稅源監控與稽查互動。稅源監控是稅務部門獲取稅收征管信息資料的主要來源，其重點是有效的稅源戶籍管理、財務核算管理、資金周轉管理和流轉額的控管，對稅源申報的真實性、合法性、準確性做出初步判斷，以保證稽查評估工作的準確性和可靠性。根據收集的稅務信息進行綜合分析、整理、篩選，並進行評估和約談，科學確定被查對象，從而使稅務稽查工作更具針對性、有效性，減少盲目性，切實發揮稽查效能。同時稽查部門定期通報稽查工作開展情況以及稽查中發現的征管環節存在的問題，提出稽查建議。稅源管理部門反饋稽查建議的落實情況及實施效果。
明確納稅評估和稅務稽查的關係。納稅評估通過關口前移的管理活動，提高納稅人依法納稅的能力和自覺性，對在評估過程中發現納稅人非故意偷逃稅款、且情節較輕微的，由稅源管理部門提請納稅人自行改正。對需要納稅人補充納稅資料，以及需要納稅人補正申報、補繳稅款、調整賬目的，稅源管理部門應監督納稅人按照稅法規定逐項落實。發現納稅人有偷稅、逃避追繳欠稅、騙取出口退稅、抗稅或其他需要立案查處的稅收違法行為，稅源管理部門必須移交稽查部門處理。建立健全監督問責機制。明確各環節間資料傳遞的步驟、時間限制、責任單位，並以嚴格的督查考核促進落實。尤其是對評估部門評而不移、隱瞞不交的，要從法律層面建立責任追究制度，追究其執法責任。