2、宣傳力度不夠。雖然通過各種方式進行了宣傳，但調查走訪發現，許多農民只知道新農合政策，但對其制度以及參合人的權利、義務、藥費報銷和管理辦法等具體內容知曉率不高，個別農民甚至存在誤解，把新農合等同於過去的合作醫療或一般的商業保險，沒有認識到這是國家的一項惠民政策。
3、區內定點醫療機構醫療行為不夠規範，基礎設施、醫療水平和服務能力還不能完全滿足新農合工作的需要。新農合制度要求：農民就診小病不出鎮，大病不出區，疑難複雜病到市級以上醫院治療。但從我區運行情況看，一些可以在鎮衛生院治療的常見病、多發病大量湧入市級醫院。一些可以在區級醫院治療的疾病卻轉到市、省級醫院。其原因：一是區內定點醫療機構存在基礎設備陳舊、經費短缺、專業技術人員匱乏、醫療技術水平有限等問題。這些問題的存在不能與新農合制度完全接軌，這是導致農合患者外流的主要原因。二是區內定點醫療機構的診療行為不夠規範：有的醫務人員不寫病志、不開處方、不填門診日誌等現象仍然存在；個別定點醫療機構還存在診療環節不透明等問題；少數醫療機構和醫務人員核對卡證不細，審查把關不嚴，填寫卡證不實，給農合基金運行帶來了風險，某種程度上降低了定點醫療機構自身的信譽；三是我區地處近郊，交通便利，這也是患者外流不可忽視的客觀原因。
4、農民反映的具體問題有三個：一是藥價高。認為定點醫療機構的藥價高於其他藥店，按比例報銷後，得到的實惠不是很多。二是患者在市級醫院住院的醫藥費予以報銷，門診花費不報，而農民多數是在門診就診，此問題意見較大，希望執行以往的醫藥費報銷制度。三是按農合管理中心的規定，患者必須在出院後八天內的星期三和星期四兩個工作日到農合中心報銷醫藥費，時間倉促，希望增加報銷醫藥費的工作日。經與區衛生局溝通，問題的情況如下：關於藥價問題：農合管理中心是代表全區定點醫療機構統一從正規的醫藥供應渠道進藥，要求定點醫療機構按規定加價15％售出；關於醫藥費報銷問題：新的農合醫藥費報銷制度是XX年市里出台的新規定，取消市級醫院門診藥費報銷項目後，大幅度提高了在市級醫院住院費的報銷比例，體現了大病統籌原則，同時將區級醫療機構門診藥費的報銷比例，從15％提高到了20％，目的就是促使農民小病不出區，讓農合資金儘量消化在區級醫療機構；關於報銷時間問題：目前，區衛生局已取消了醫藥費報銷時限，規定年度內發生的醫藥費在本年報結。
三、對完善新型農村合作醫療制度的幾點建議
1、加大宣傳力度，為新農合工作長遠發展奠定基礎
一是根據農村民眾生活方式、文化水平的特點，將經常性宣傳與集中性宣傳相結合，將新農合知識的宣傳與健康教育宣傳相結合。採取多種形式把黨和政府惠及農民民眾的新農合，全面準確及時有效地宣傳好，使之家喻戶曉。要利用發生在身邊的生病得資助、無病保平安的典型事例引導民眾，幫助民眾樹立衛生保健意識、健康風險意識、互助共濟意識和參合監督意識，在自願原則下最大化地提高農民的參合積極性和自覺性。通過宣傳，讓民眾明白費用補償的支付辦法和程式，清楚參加新農合後應享受的權益，打消顧慮，放下包袱，使他們真正放心地參加新農合。二是新農合定點醫療機構應當對本單位的醫務人員進行相關培訓，使其掌握新型農村合作醫療的基本政策、基本作法和基本要求，能夠對參合農民及其家屬進行相關政策的宣傳、解釋和說明。