從實踐來看，產生這些問題的原因是多方面的，既有主觀方面的因素，也有客觀環境的影響，主要可以概括為“四個不足”：一是農村改革開放發展勢頭迅猛，在幹部和思想的準備上顯得不足；二是對市場經濟產生的負面效應以及市場經濟對農村黨建工作的挑戰認識不足，相應的措施沒有跟上，也不配套；三是少數基層幹部“兩手抓”的素質具備不足，農村黨建工作擺不上位置，削弱了黨的領導，造成了實際工作中的一手硬、一手軟，出現“兩張皮”的現象；四是黨的建設上理論準備不足，黨建工作的理論研究相對滯後，在實際工作中產生了一些偏差。
二、加強農村基層黨組織建設的思考及對策
近年來，我們解放思想，大膽實踐，緊緊圍繞經濟建設這箇中心，積極探索社會主義市場經濟條件下農村基層黨組織建設的新路子。通過幾年的農業、農村工作實踐和理論學習，我以為加強農村基層黨組織建設應從以下幾外方面抓起。
（一）以黨的基本路線為指針，準確把握農村黨建工作的指導思想和工作方向。
第一，在農村兩個文明建設的全局中，市委必須首先把農村基層黨組織這個"前沿指揮部"建設好。從我們且末農村基層黨組織建設和經濟發展的實際來看，經濟建設和黨的建設表現出了明顯的一致性，哪裡的基層黨組織戰鬥有力，那裡的工作就紮實有效，經濟建設就能迅速發展。反之，一些地區之所以長期發展不起來，經濟落後，就是因為這些地區的基層黨組織戰鬥力不強，缺乏一個帶領民眾共同致富的好的帶頭人，缺少一個發展壯大集體經濟的好路子；一些地方人心渙散，治安混亂，思想文化道德水準下降，宗教氛圍不斷濃厚，也是因為基層黨組織作用弱化，農村思想政治工作鈍化所致。實踐證明，基層黨組織強，一強百強；黨員幹部作用好，一好百好；集體經濟富，一富百富。因此，農村工作千條萬條，首先一條就是要把農村基層黨組織這個“前沿指揮部”建設好、鞏固好，這是搞好農村工作、推動農村兩個文明建設的關鍵環節和首要前提。
第二，在農村黨建工作的實踐中，必須把黨的建設與經濟建設的關係處理好。黨的建設必須緊緊圍繞經濟建設這箇中心進行，服從服務於這箇中心。服務與被服務的關係是不能顛倒的，經濟建設為中心的位置不能代替，但是，這種“服從”不是被動的適應，也不是被動的服務，不能理解為黨的建設只是被動地圍繞經濟工作來搞。農村黨建工作如果停留在被動適應上，那么黨建工作搞不好，經濟工作也搞不好。黨建工作為經濟建設服務的作用：一是政治上的把關定向。“農業、農村和農民問題，關係著黨的執政地位的鞏固，關係著國家的長治久安，這不但是個重大的經濟問題，同時也是個重大的政治問題”。領導幹部不了解“三農”是不稱職的表現，不重視“三農”是政治上不清醒的表現。農村黨建工作首先必須保證黨在農村的各項方針、政策的貫徹執行，確保農村經濟正確的發展方向。二是思想上的宣傳激勵。發揮黨的政治優勢，結合實際積極宣傳黨的政策和主張，把各級黨委確定的戰略思想、發展目標、工作舉措，變成廣大幹部民眾的自覺行動。三是組織上的保障。建設一個政治穩定、素質優良、作風過硬、戰鬥力強的領導班子，為經濟發展選好配強能打硬仗的幹部人才隊伍。四是創造優良的政治、社會環境。通過加強黨的建設，樹立良好形象，密切黨群、幹群關係，以好的黨風帶一個好的政風、民風，為經濟發展提供良好的穩定向上的政治環境和社會環境。