二、村支兩委職權關係問題產生的原因分析
1、歷史問題。在計畫經濟時期，黨管一切作用特徵比較突出，村支書與大隊長（相當於現在的村主任）排行就是老大、老二，兩者之間關係還算可以。改革開放後，農村實行家庭承包制以來，隨著生產隊的解體和村委會的建立，村黨支部與村委會的關係開始出現不和諧音符；隨著“村為主”、村民自治後，兩者之間的矛盾日趨顯現。因此，村支兩委的職權關係問題，與歷史原因分不開。
2、村民無權自治問題。《黨章》中明確
規定了一條組織原則，即“下級服從上級”。這一原則被延伸在基層政權組織中，民眾就作為政權落實和主體，而村級組織要承擔起各項繁重的工作任務，只有依靠民眾，而民眾無能力自發展，只有依靠上級組織的指令，上級組織為完成任務，將各種工作內容細化、分解到村級，實行量化考核，村級組織承擔相當大的壓力，受“村民自製”法制化的約束，根據村民自治有關規定，上級政府不干預村級各項事務，由村自我管理、自我發展、自我服務，上級政府可以做到這一點，不干預村委會自我發展，但對村支部是絕對領導，村支部又通過其在村委會中的權威地位，領導村委會開展工作，成了實際意義上的絕對領導。又如，在村民委員會選舉工作中，能夠體現民主的選舉實質上微乎其微，村委領導班子的選舉產生，村黨支部負有領導責任，而村支部又不能違背上級組織的意圖，大多是為了實現組織意圖，而不是人民意願。在這一問題上，村支部卻成了“替罪羊”，村委領導班子組織上間接任命的，民眾心裡不服，但又不敢表露，引發村委在施政過程中的不順利，村委不勘重負，完不成任務，村支部可能會強行施政，會引發村支兩委的關係。
3、認識誤區。在具體的工作中，不知是上級組織對支部工作成績的渲染，還是強調支部在基層組織戰鬥堡壘中的作用，評優評先總以支部為先，造成民眾世界觀認識的錯覺，村工作的好壞，應該歸功於誰？是民眾還是領導班子？還是班子中的個人？當然，成績的取得，是歸功於民眾，但榮譽卻領導班子或領導班子中個人的，因此有“村看村、戶看戶、民眾看幹部”，“給錢給物不如配個好支部”、“火車跑得快，全靠車頭帶”等的經驗或口號。有些“成績”不是真實可靠的，是領導為了達到某種目的，“吹”出來的，由於民眾生活在最低層面，受條件的限制，產生了錯覺。
4、各種關係不平衡。由於政治體制與經濟體制的不協調，受傳統教育、民主文化的缺乏、地理條件限制、信息遲緩等因素的影響，村民自治的問題，由於開發中國家政治功能的超強，農村基礎功能薄弱，一時難以協調。權力高度集中的政治體制，導致基層組織處於被動狀態。通過各種宣傳、學習等手段，控制社會輿論和人的思想意識，導致社會生活政治化。政治民主化進程興步唯艱，依法行政一時難以推進，如在《人口與計生法》頒布實施後，依法行政效果不佳，還是要依靠很多行政措施、行政手段執行。民眾受市經濟體制的影響，無暇顧及民主，意識淡薄，權力越集中，民主就越少，行政命令的暢通，致使決策因缺乏民主而造成失誤。
四、對策與建議
1、明確各自的職權
正確認識村支兩委辨證統一關係，是妥善處理兩委關係的前提。村支部與村委會之間一方面緊密相連，兩者工作目標一致，共同擔負著整合農村社會資源、保持超大社會政治一體化的任務，另一方面兩者的職責又是相互區別的。村黨支部是中共共產黨在農村的基層組織，在村民自治中居於領導核心地位，按照黨章進行工作，負責黨的路線、方針、政策和上級黨組織決議的貫徹執行，領導村民自治及本村的全面工作，協調各方，但不干預村委會職權範圍內的事務，支持和保障村民開展自治活動，直接行使民主權利，支持和保證村民自治組織充分行使職權。村民委員會是村民自我管理、自我教育、自我服務的基層民眾性自治組織，負責辦理村公共事務和公益事業，調解民間糾紛，協助維護社會治安，向人民政府反映村民意見、要求和提出建議，組織村民發展經濟，提供生產服務，協助鄉政府開展工作。