（二）案件防控工作內容不系統。一是由於營業網點點多面寬與案件防控工作人力資源不足的矛盾難以解決，以致案件防控檢查內容不全面，可能存在風險隱患遺漏的情況。二是時效性和有效性不相容，由於檢查網點時間短，以致對檢查內容的風險發現不足。三是案件防控檢查內容與其他專項檢查、稽核內審和安全檢查內容存在一定的重複。
（三）案件防控機制有待進一步改善。一是案件防控獨立性不充分，相關監管法規和行業規章沒有明確對案件防控工作的獨立性作出明確的規定，其獨立性在一定程度上缺乏法規支撐。二是案件防控職能與業務監管的某些職能形成了模糊交叉，一定程度上增加了監管成本，形成監管資源浪費。三是由於案件防控檢查內容覆蓋的全面性，案件防控機構有形成監管機構外的監管機構的趨勢。
（四）案件防控效果需進一步加強。一是對案件防控檢查發現問題督促整改力度不夠，以致有些案件防控檢查發現問題屢查屢犯。二是被檢查機構對巡查發現問題整改力度不夠。
四、改進途徑
（一）強化組織機構建設，正名分。一是應將案防辦作為一重要的內部監管機構，有人有編制，杜絕“以工代工”現象。二是加強案件防控人員教育，一方面要加強思想教育，建立有效“誰檢查，誰負責”的機制，對工作不負責的要充分履行退出機制；另一方面，要切實加強案件防控業務技能培訓，不止只要學習監管法規，還要學習和了解新業務，掌握新技能，熟悉各項業務的風險要點和流程，努力確保案件防控檢查的有效性。
（二）強化部門職能建設，明職責。一是進一步明確部門職責，一方面要不斷探索和改進案件防控檢查內容，按照“點面結合、突出重點”的原則，結合農村信用社內部控制薄弱領域和風險隱患狀況，選準檢查重點機構、重點人員、重點環節、重點業務，持續開展易發風險檢查；另一方面進一步明確案件防控職能，突出隨機性；第三將縱深風險隱患排查職能分離，交予職能部室或稽核內審部門進行，將重點放在易發風險業務和環節，努力避免監管資源的浪費。二是加強案件防控獨立性建設，相關內部規章應明確案件防控檢查與相關檢查的同等地位，重視案件防控部門的作用。三是加強案件防控制度建設，在實踐中不斷健全辦公案件防控檢查、考核、督辦工作、工作人員問責、案件防控日報等規章制度，注重長效機制建設。
（三）強化考核機制建設，明效果。一是要加強自身案件防控工作考核，第一要強化案件防控人員考核，以德、能、勤、績、廉為主要內容，強化紀律性，提升案件防控人員戰鬥力；第二強化案件防控工作的考核，其一要考核其案件防控工作的規範性，強調案件防控檢查的程式性，做到有理、有利、有節，做到以己為范，其二要加大案件防控檢查內容的考核，堅持“誰檢查，誰負責”的原則，努力做到全機構、全業務、全風險覆蓋。二是強化案件防控檢查發現問題的整改考核，杜絕重檢查輕整改的現象，切實扭轉屢查屢犯的不利局面。三是要加強各級農村信用社的考核，重點放在發現問題的整改效果上和規章制度的執行上，強化各級農村信用社和個職能部門要自查自糾，自我暴露和自我整改，要求各級農村信用社整改台賬反映的風險隱患要有整改落實、責任人處理、後續審計整改措施，在對整改不力或出現新問題，加大對管理部門的考核力度，按照銀監會“三掛鈎”原則對高管問責，對整改不力負有領導和管理責任的人員進行從嚴問責。