三是體制不順，管理混亂。從目前已建立農村養老保險地區的情況看，農村社會保險機構只在縣級以上才設立，鄉鎮還沒有健全機構，行政村也沒有設立代辦員，專業人員更是寥寥無幾。由於技術落後，管理混亂，還出現了個別違規操作的挪用和擠占行為。
四是經費短缺，工作開展困難。根據《基本方案》規定允許從基金中提取3%的管理費來彌補業務經費的不足，很多經辦部門就是依靠這筆費用來維持日常的業務工作。而在實施過程中，很多地區的同級財政從未劃撥過農保工作的專項經費，致使工作開展的難度加大。
另外，隨著我區工業化、城鎮化的快速發展，農村牧區大量集體土地被徵用，大批農民工進城務工，失地農牧民和進城務工農牧民的養老保障問題日益突出。尤其是失地農牧民，由於征地的安置補償機制不健全、社會保障缺位，其中相當多的人成為“無地、無業、無社會保障”的“三無”人員，直接影響了被征地農民的切身利益和社會穩定。失地農牧民問題已經成為一個比下崗工人問題更為嚴重的社會問題，各級政府和社會各界應給於更多地關注。
二、建立和完善我區農村牧區養老保障的政策建議
1.提高對農村牧區養老問題和完善農村社會保障體系重要性的認識。這主要指各級政府和村民委員會應當對農村養老問題有一個正確的認識，決不能將養老仍然看成是一家一戶自己的事情。老齡化是大勢所趨，勢不可擋，家庭養老勢單力薄，難以為繼。我們必須對農村養老保障體系建設保持足夠清醒的認識。多年來將老年社會保障視為城鎮居民的專利，這不符合社會保障的公平價值原則，這與全面建設小康社會重點在農村和農民的發展思路相背離。因此，我們要充分認識建立農村養老保障體系的重大意義、存在問題、潛在危機，萬萬不可持無關緊要的態度。
2.鞏固和完善家庭養老機制。家庭養老是我國傳統的養老方式，是與傳統大家庭和以家庭為單位的小生產相聯繫的一種方式，也是老年人最感舒服的一種方式。雖然現代的生產生活方式使家庭養老受到嚴峻挑戰，社會養老成為現代必不可少的養老方式。但是家庭養老並不是就要消亡，相反，它還是一種很重要和最主要的養老方式。這是由我國處於社會主義初級階段的基本國情決定的。我國目前經濟基礎還比較薄弱，國家不可能拿出足夠的資金用於養老方面，而且，中國人傳統的親情養老，不管社會如何發展，也無法取代。因此，家庭養老仍具有強大的生命力，不會被社會養老完全代替。在目前我們應積極培養、發展和完善它。要積極建設和宣傳新的養老觀，鼓勵和支持簽定養老協定書，充分發揮老年協會組織對強化家庭養老的重大作用，加大執法力度，對不贍養老人的子女嚴格執法等等。
3.堅持因地制宜與自願的原則，避免農村牧區養老保險制度的“一刀切”。我區地區差異大，受經濟發展水平、經濟承受能力、保險意識等方面的制約，短期內讓農牧民普遍參加社會養老保險條件不成熟。要避免強迫農牧民參加的做法，杜絕“好心辦壞事”。因為這不僅增加了農牧民的負擔，而且也不可能持久。只有堅持自願原則，並通過政府補貼、集體補助與政策引導，才能使這項工作健康持續地運行。要鼓勵有條件的地區先搞，以點帶面，在總結成功經驗的基礎上，再逐步推進。