跨越河道的管道、線路的淨空高度必須符合防洪和航運的要求。
在河道兩岸及灘地修建碼頭、泵房、船台、道路等建築物及設施，一般不得伸出岸灘或超出灘地的高程。確需伸出岸灘或高出灘地的，應儘可能減少阻水面積，並經河道主管機關批准。
第十五條 在河道管理範圍內修建的工程所涉及堤段的維修、管理和防汛任務，在建設期間由建設單位負責，工程交付使用後由使用單位負責，河道主管機關及河道管理機構應當檢查、監督和指導。
第十六條 確需利用堤防或護堤地兼做公路的，必須按本辦法第十條規定的程式履行報批手續，並按規定要求施工。
未鋪路面的堤防，在泥濘期間，除防汛搶險車輛外，其他車輛不得通行；已鋪路面的堤防，除防汛搶險車輛外，河道管理機構應根據路面鋪設標準對其他車輛限制通行。
第十七條 城鎮建設和發展不得占用河道灘地。沿河城鎮在編制和審查規劃時，應當事先徵求河道主管機關的意見。
第四章 河道保護
第十八條 有堤防的河道，其管理範圍為：兩岸堤防之間的水域、沙洲、灘地（包括可耕地）、兩岸堤防及護堤地；無堤防的河道，其管理範圍為歷史最高洪水位或者設計洪水位以內的區域；長江乾堤及其成圈堤防的以山代堤段，其管理範圍不小於相鄰堤防的管理範圍。
第十九條 堤防兩側必須有護堤地，凡已預留、徵用、劃撥、歷史形成或公認的護堤地，包括堆土區、加固堤防填塘區、外灘地、壓滲平台、防滲鋪蓋和減壓井等，屬於國家所有的，按《中華人民共和國土地管理法》的規定，由市、縣（區）人民政府登記造冊，確權發證，埋設界樁，由河道管理機構負責管理使用；屬於集體所有的，其使用接受河道管理機構監督、管理。
新建堤防或尚無護堤地的堤段，由市、縣（區）人民政府按批准的堤防設計標準劃定護堤地：
（一）長江江堤，臨水側不得少於50米，背水側不得少於30米；
（二）市區的鋼筋砼防洪牆，臨水側所有的坡地、灘地，背水側從原土堤腳起不得少於10米，從防洪牆起不得少於15米；土堤臨水側不得少於30米，背水側不得少於20米；
（三）5萬畝以上圩口堤防，臨水側不得少於30米，背水側不得少於20米；
（四）其他河道的堤防，臨水側和背水側均不得少於10米。
第二十條 堤防兩側營造防護林、條，必須符合防洪安全要求。
河道堤防的防護林、條，由河道管理機構負責組織營造和管理，間伐、更新必須經縣以上河道主管機關批准；進行撫育、更新性採伐和用於防汛搶險的採伐，按國家規定免交育林基金。
第二十一條 禁止從事下列活動：
（一）在河道內修建圍牆、圍灘、房屋等阻水、挑流工程，設定攔河漁具，棄置礦渣、煤灰、泥土、垃圾、沉船、排筏；
（二）擅自在堤防、護堤地範圍內建房、放牧、開渠、打井、挖窖、立窯、埋葬、挖塘、取土、采砂石、爆破、開展集市貿易；
（三）在堤防安全保護區進行打井、鑽探、爆破、挖築池塘、採石、取土等危及堤防安全活動；
（四）在堤身鏟草皮，挖堤築路，傍堤蓄水；
（五）在堤身防滲鋪蓋、壓滲平台上植樹；
（六）在堤身、岸坡及臨河十米寬的灘地上耕種；
（七）在河道防護林以外的河灘地、行洪通道內栽植高桿作物；
（八）在水閘管理範圍的水域內捕魚、停船（閘管單位因工作需要除外）。
第二十二條 禁止在城市防洪牆頂平台及通道行駛各類車輛，損壞防洪牆設施、翻越欄桿、穿越和跨越防洪牆進行黃砂運輸等活動。
第二十三條 進行下列活動，必須報經河道主管機關批准；涉及其他部門的，由河道主管機關會同有關部門批准：
（一）在河道管理範圍內采砂石、取土、淘金等；
（二）在河灘地存放物料，開採地下資源，進行考古發掘和修建工程設施；
（三）填高河灘地面、向河道內拋石、沉梢以及進行其他影響河道泄洪和堤防安全的活動；
在內河河道內采砂，必須領取河道主管機關頒發的批准證書，方可開採；在長江河道內采砂依據國務院《長江河道采砂管理條例》的有關規定執行。
第二十四條 長江堤防、城市圈堤、5萬畝以上圩口堤防等重要堤防應當劃定安全保護區（一般堤段管理範圍外100米內，砂基堤段管理範圍外200米內）。在安全保護區內一般不得鑽探、爆破、挖礦、打井、挖塘等，特殊情況確需進行的，應徵得河道主管機關同意。
第二十五條 在河道、涵閘管理範圍內禁止堆放、傾倒、掩埋、排放污染水體的物體。禁止在河道內清洗裝貯過油類或有毒污染物的車輛、容器。