（二）由於電子檔案信息與載體的可分離性，檔案實體分類也可能將被概念分類整理所取代，因為實體分類的結果只能體現一種屬性聯繫，這種單線排列的方式是手工操作管理檔案的需要，但在當今電子檔案的環境中，檔案的形式特徵和內容特徵均發生了變化，電子檔案可以通過計算機系統進行迅速、有效、多角度的整序，不再需要對它進行象紙質檔案那樣的分類整理。不同的用戶可以根據不同的需要，利用辦公自動化系統對電子檔案進行自由組合分類。
（三）由於電子檔案的保存價值同時取決於其自身價值和可讀性，其鑑定的方法、內容、標準均將發生變化，原有的檔案價值理論分析範圍也將擴大，要分析電子檔案的讀取軟體甚至作業系統。根據傳統的檔案價值鑑定理論，檔案應根據其憑證價值和參考價值確定保管期限，而電子檔案一方面由於製作方便，將產生比以往更多的檔案，另一方面由於用戶的需要，信息和數據不斷地修改和補充，因此很難劃定固定的保管期限，況且目前電子檔案的憑證價值憑證價值尚無法律保證。因此，其鑑定、管理方法亦無定論。此外，由於電子檔案信息載體的特殊性，其保管方法、要求以及檢索和對外利用等方面也與紙質檔案有許多不同之處。
四、電子檔案在稅務檔案管理中的運用
（一）做好歸檔電子檔案的技術處理工作，實施電子檔案管理戰略
新型檔案材料的歸檔勢在必行，這就要求檔案工作者必須深入到現行檔案工作領域，對產生的大量電子檔案的接收、處置及至存儲工作進行指導，保護電子檔案的原始信息，了解檔案信息重新組合的來龍去脈。也就是說，通過採取技術處理，將已歸檔的電子檔案改為唯讀性檔案，即只能讀不能寫的不可更改的檔案，從而識別和保護電子檔案的原始結構，保證電子檔案的可靠性，使之與紙質檔案一樣發揮社會效用。
（二）解決好電子檔案的保存問題
以化學磁性材料為載體的電子檔案，從理論上講能夠長期保存，因為它的信息讀出是無接觸式的，不存在磨損。電子檔案記錄在介質層上的信息被密封在塑膠保護層內，不怕外界磁場的影響，不會直接受到空氣中的灰塵、水份及有害氣體的侵害。但是，由於電子檔案形成的時間短，缺乏實際貯存的驗證，所以，電子檔案中原始信息的長期保存問題是有待檔案工作進行深入研究和探討的重要課題。目前，對於長久保存的電子檔案需要定期進行複製，以防止信息損失。
（三）使檔案管理向立體化方向發展
以前的檔案管理是呈直線狀態的，隨著人們對利用服務工作的重視，使利用工作和其它基礎工作構成一個平面。這種平面結構只反映紙質檔案的情況，隨著電子檔案的介入，檔案種類在增加，其基礎工作和利用工作也都具有各自的個性。因此，在原有平面結構基礎上，又增加了一項檔案信息載體內容，就構成三維空間，形成了立體化的管理結構。