5.2事件評估
在監測到突發公共衛生事件信息後，事發地縣級衛生行政部門應立即組成專家評估組到事件現場進行現場評估；並根據事件嚴重程度，逐級啟動專家評估機制。
5．3預警決定
涉及全省性突發公共衛生事件，由省級衛生行政部門提出預警建議，報省應急委批准後發布。涉及局部地區的突發公共衛生事件，由事件發生地州（市）或縣（市、區）人民政府依照本級衛生行政部門的建議提出預警建議，報請省應急委批准後發布。
5．4啟動應急預案
重大和特別重大突發公共衛生事件啟動省級應急預案，根據需要請求啟動國家級預案，由省級指揮機構、工作機構組織應急處理。較大突發公共衛生事件啟動州（市）級應急預案，由州（市）級指揮機構、工作機構組織應急處理。一般突發公共衛生事件啟動縣級應急預案，由縣（市、區）級指揮機構、工作機構組織應急處理。
5．5調集應急資源
發生或可能發生突發公共衛生事件時，事發地或預警地人民政府及衛生行政部門應及時組織調集本行政區域的應急資源儲備，保障應急需求。
5.6集結應急救援隊伍
發生重大和特別重大突發公共衛生事件時，省人民政府及衛生行政部門應根據預案要求，迅速形成應急救援具體工作方案，集結與事件應急處理需要相適應的應急救援隊伍，並做好應急救援的各項準備。較大或一般突發公共衛生事件的救援隊伍集結，原則上由州（市）級或縣（市、區）級人民政府和有關政府行政部門負責。
5.7啟動區域協作機制
應急處理中，充分考慮不同救援組織的地理、交通、資源優勢，打破原有的行政隸屬關係，按距離優先、時間優先、資源優先原則，調用應急資源和應急力量，以最大限度縮短事件現場獲得應急支援的時間。
5.8組織現場應急處理
場應急處理按照屬地管理原則組織，遵循邊調查、邊處置、邊的現場處置原則，實施現場救治、調查、控制措施並舉。現場應急管理中必須遵循安全第一的原則，確保應急救援的安全性。現場應急管理工作由現場指揮所負責統一領導、組織和協調。
5．9現場封鎖或撤離
在發生甲類傳染病暴發流行時，各級人民政府可依照相關法律法規，組織對傳染病疫區實施封鎖，必要時實行交通衛生檢疫。在發生其他嚴重突發公共衛生事件危及民眾安全時，應及時組織民眾從高危地區撤離。
5．10妥善救治事件受害者
各級衛生行政部門和民政部門負責組織突發事件受害者的救治和救濟；財政部門予以必要的經費支持；其它部門在職責範圍內予以協助。各級醫療機構對突發公共衛生事件受害者的救治實行“先救治，後結算”，不得拘收。
5．11外籍及港澳台人員應急救援
突發公共衛生事件中發現有外籍或港澳台人員遇險時，救援人員應立即報告事發地縣（市、區）級衛生行政部門；衛生行政部門應立即報告同級政府、上級政府外事部門（或港澳台辦）和上級衛生行政部門。重要人士、知名人士的基本情況應同時向省政府外事辦公室（或港澳台辦）和省衛生廳報告。
5．12事件終止與善後處理
突發公共衛生事件相關危險因素消除後，應及時終止應急反應，及時發布應急終止信息，並撤銷現場指揮機構。各級應急救援隊伍和人員在完成現場應急處理任務後，經現場處突指揮機構和派出的政府機構批准，應及時撤離事件現場。處理重大傳染病疫情和群體不明原因性疾病、危險化學品泄漏、放射事故等易污染事件的應急隊伍從高危現場撤離時，應對相關人員進行必要的健康檢查或留驗觀察；對設備進行去污消毒處理。