2、檢查稅前扣除項目的真實性、合法性。一是要重點檢查構成房地產成本的各類費用的支付憑證是否合法、真實、有效，有無收受虛開、代開、偽造的假髮票等不合法的發票入賬支付費用，尤其是建安企業和個人所提供的安裝工程成本是否真實；總局要求在檢查中，要對被查企業列支成本費用的票據進行重點核對，單張票面金額在10萬元以上的票據必須全部進行核查，核實該項業務是否真實存在，發票是否合法有效；重點查看是否存在虛開辦公費、虛開服務業發票、虛增人員工資、虛增廣告支出、以有關聯關係的銷售公司或辦事處的名義虛增經費、銷售費用等虛增成本套取現金的情況。二是要通過檢查總成本、已完工成本、總面積、已完工（可售）面積來檢查成本與收入的配比性、合法性，是否將未完工程項目的成本轉移到已完工程成本項目中。三是要結合房地產行業的特點，針對會計處理與現行稅法規定不一致的項目在納稅申報時是否予以調整，重點檢查各項準備金、風險金、業務招待費、廣告費、租賃費、工資及相關費用、財產損失、捐贈支出、改擴建及裝修工程支出、管理費等項目，以及支付的土地出讓金是否按規定合理分攤成本。
3、重點檢查項目。一是檢查應付未付、應收未收款項的處理情況，是否存在預售款長期掛“預收賬款”、“其他應付款”等科目，不按照規定繳納所得稅問題；二是檢查預提費用、應付賬款等科目，對年末留有餘額的預提費用和超過3年（外企2年）因債權人原因無法支付的應付賬款應調整成本和收入；三是檢查無形資產和長期待攤費用的攤銷是否符合稅法規定；四是檢查企業與其關聯企業之間的關聯交易情況，是否利用關聯關係承包或分包工程,如建築、裝飾、建材、綠化和物業等,通過加大建安成本造價、虛加工作量等非法手段減少或轉移利潤，或委託關聯企業代理銷售開發產品，支付高額佣金轉移利潤等；五是檢查房地產項目中建造的各類營業性的“會所”是否按規定作為固定資產管理；六是檢查企業按重估價計提折舊的固定資產，看其重估收益是否申報繳納企業所得稅等。七是檢查開發企業開發、建造的住宅、商業用房以及其他建築物、附著物、配套設施等開發產品，在其未完工前採取預售方式銷售的，其預售收入先按20％的預計計稅毛利率分季(或月)計算出當期毛利額，扣除相關的期間費用、營業稅金及附加後再計入當期應納稅所得額，預繳企業所得稅。
4、稅法規定：開發企業將開發產品轉作固定資產或用於捐贈、贊助、職工福利、獎勵、對外投資、分配給股東或投資人、抵償債務、換取其他企事業單位和個人的非貨幣性資產等行為，應視同銷售，於開發產品所有權或使用權轉移，或於實際取得利益權利時確認收入（或利潤）的實現，確認收入（或利潤）的方法和順序為：
（1）按本企業近期或本年度最近月份同類開發產品市場銷售價格確定；
（2）由主管稅務機關參照當地同類開發產品市場公允價值確定；
（3）按開發產品的成本利潤率確定。開發產品的成本利潤率不得低於15%,具體比例由主管稅務機關確定。
（三）房地產業企業契稅
在檢查中發現，部分企業在承受國有土地使用權過程中，土地使用證已辦，項目已經開發但還存在查補契稅的情況，原因一是在國土資源局辦土地證提供的契約不全，未足額繳納契稅，二是重新簽定了補充協定，追加了補償款，未來補繳這部分契稅，根據稅法規定：出讓國有土地使用權的，其契稅計稅價格為承受人為取得該土地使用權而支付的全部經濟利益，以協定方式出讓的，其契稅計稅價格為成交價格。成交價格包括土地出讓金、土地補償費、安置補助費、地上附著物和青苗補償費、拆遷補償費、市政建設配套費等承受者應支付的貨幣、實物、無形資產及其他經濟利益。