六年春正月丙辰，改舂陵鄉為章陵縣。世世復徭役，比豐、沛，無有所豫。辛酉，詔曰："往歲水、旱、蝗蟲為災，谷價騰躍，人用睏乏。朕惟百姓無以自贍，惻然愍之。其命郡國有谷者，給稟高年、鰥、寡、孤、獨及篤癃、無家屬貧不能自存者，如《律》。二千石勉加循撫，無令失職。"
揚武將軍馬成等拔舒，獲李憲。
二月，大司馬吳漢拔朐，獲董憲、龐萌，山東悉平。諸將還京師，置酒賞賜。
三月，公孫述遣將任滿寇南郡。
夏四月丙子，幸長安，始謁高廟，遂有事十一陵。遣虎牙大將軍蓋延等七將軍從隴道伐公孫述。
五月己未，至自長安。
隗囂反，蓋延等因與囂戰於隴阺，諸將敗績。辛丑，詔曰："惟天水、隴西、安定、北地吏人為隗囂所詿誤者，又三輔遭難赤眉，有犯法不道者，自殊死以下，皆赦除之。"
六月辛卯，詔曰："夫張官置吏，所以為人也。今百姓遭難，戶口耗少，而縣官吏職所置尚繁，其令司隸、州牧各實所部，省減吏員。縣國不足置長吏可併合者，上大司徒、大司空二府。"於是條奏並省四百餘縣，吏職減損，十置其一。
代郡太守劉興擊盧芳將賈覽於高柳，戰歿。
初，樂浪人王調據郡不服。秋，遣樂浪太守王遵擊之，郡吏殺調降。
遣前將軍李通率二將軍，與公孫述將戰於西城，破之。
夏，蝗。
秋九月庚子，赦樂浪謀反大逆殊死已下。丙寅晦，日有食之。
冬十月丁丑，詔曰："吾德薄不明，寇賊為害，強弱相陵，元元失所。《詩》云：'日月告凶，不用其行。'永念厥咎，內疚於心。其敕公卿舉賢良、方正各一人；百僚並上封事，無有隱諱；有司修職，務遵法度。"
十一月丁卯，詔王莽時吏人沒人為奴婢不應舊法者，皆免為庶人。
十二月壬辰，大司空宋弘免。癸巳，詔曰："頃者師旅未解，用度不足，故行什一之稅。今軍士屯田，糧儲差積。其令郡國收見田租三十稅一，如舊制。"
隗囂遣將行巡寇扶風，征西大將軍馮異拒破之。
是歲，初罷郡國都慰官。始遣列侯就國。匈奴遣使來獻，使中郎將報命。
七年春正月丙申，詔中都官、三輔、郡、國出繫囚，非犯殊死，皆一切勿案其罪。見徒免為庶人。耐罪亡命，吏以文除之。又詔曰："世以厚葬為德，薄終為鄙，至於富者奢僣，貧者單財，法令不能禁，禮義不能止，倉卒乃知其咎。其布告天下，令知忠臣、孝子、慈兄、悌弟薄葬送終之義。"
二月辛巳，罷護漕都尉官。
三月丁酉，詔曰："今國有眾軍，並多精勇，宜且罷輕車、騎士、材官、樓船士及軍假吏，令還復民伍。"
公孫述立隗囂為朔寧王。
癸亥晦，日有食之，避正殿，寢兵，不聽事五日。詔曰："吾德薄致災，謫見日月，戰慄恐懼，夫何言哉！今方念愆，庶消厥咎。其令有司各修職任，奉遵法度，惠茲元元。百僚各上封事，無有所諱。其上書者，不得言聖。"
夏四月壬午，詔曰："比陰陽錯謬，日月薄食。百姓有過，在予一人，大赦天下。公、卿、司隸、州牧舉賢良、方正各一人，遣詣公車，朕將覽試焉。"
五月戊戌，前將軍李通為大司空。甲寅，詔吏人遭飢亂及為青、徐賊所略為奴婢下妻，欲去留者，恣聽之。敢拘制不還，以賣人法從事。
是夏，連雨水。
漢忠將軍王常為橫野大將軍。
八月丁亥，封前河間王邵為河間王。
隗囂寇安定，征西大將軍馮異、征虜將軍祭遵擊卻之。
冬，盧芳所置朔方太守田颯、雲中太守喬扈各舉郡降。
是歲，省長水、射聲二校尉官。
八年春正月，中郎將來歙襲略陽，殺隗囂守將而據其城。
夏四月，司隸校尉傅抗下獄死。隗囂攻來歙，不能下。閏月，帝自征囂，河西大將軍竇融率五郡太守與車駕會高平。隴右潰，隗囂奔西城，遺大司馬吳漢、征南大將軍岑彭圍之；進幸上邽，不降，命虎牙大將軍蓋延、建威大將軍耿弇攻之。潁川盜賊寇沒屬縣，河東守守兵亦叛，京師騷動。
秋，大水。
八月，帝自上邽晨夜東馳。
九月乙卯，車駕還宮。庚申，帝自征潁川盜賊，皆降。安丘侯張步叛歸琅邪，琅邪太守陳俊討獲之。戊寅，至自潁川。
冬十月丙午，幸懷。
十一月乙丑，至自懷。
公孫述遣兵救隗器，吳漢、蓋延等還軍長安。天水、隴西復反歸囂。