崔祖思，字敬元，清河東武城人，崔琰七世孫也。祖諲，宋冀州刺史。父僧護，州秀才。祖思少有志氣，好讀書史。初州避主簿，與刺史劉懷珍於堯廟祀神，廟有蘇侯像。懷珍曰："堯聖人，而與雜神為列，欲去之，何如？"祖思曰："蘇峻今日可謂四凶之五也。"懷珍遂令除諸雜神。
太祖在淮陰，祖思聞風自結，為上輔國主簿，甚見親待，參豫謀議。除奉朝請，安成王撫軍行參軍，員外正員郎，冀州中正。宋朝初議封太祖為梁公，祖思啟太祖曰："讖書雲'金刀利刃齊刈之'。今宜稱齊，實應天命。"從之。轉為相國從事中郎，遷齊國內史。建元元年，轉長兼給事黃門侍郎。
上初即位，祖思啟陳政事曰："《禮誥》者，人倫之襟冕，帝王之樞柄。自古開物成務，必以教學為先。世不習學，民罔志義，悖競因斯而興，禍亂是焉而作。故篤俗昌治，莫先道教，不得以夷險革慮，儉泰移業。今無員之官，空受祿力。三載無考績之效，九年闕登黜之序。國儲以之虛匱，民力為之凋散。能否無章，涇渭混流。宜大廟之南，弘修文序；司農以北，廣開武校。台府州國，限外之職，問其所樂，依方課習，各盡其能。月供僮乾，如先充給。若有廢墮，遣還故郡。殊經奇藝，待以不次。士修其業，必有異等，民識其利，能無勉勵？"
又曰："漢文集上書囊以為殿帷，身衣弋綈，以韋帶劍，慎夫人衣不曳地，惜中人十家之產，不為露台。劉備取帳鉤銅鑄錢以充國用。魏武遣女，皂帳，婢十人；東阿婦以繡衣賜死，王景興以淅米見誚。宋武節儉過人，張妃房唯碧綃蚊幬，三齊穀席，五盞盤桃花米飯。殷仲文勸令畜伎，答雲'我不解聲'。仲文曰'但畜自解'，又答'畏解，故不畜'。歷觀帝王，未嘗不以約素興，侈麗亡也。伏惟陛下，體唐城儉，踵虞為朴，寢殿則素木卑構，膳器則陶瓢充御。瓊簪玉箸，碎以為塵，珍裘繡服，焚之如草。斯實風高上代，民偃下世矣。然教信雖孚，氓染未革，宜加甄明，以速歸厚。詳察朝士，有柴車蓬館，高以殊等；雕牆華輪，卑其稱謂。馳禽荒色，長違清編，嗜音酣酒，守官不徙。物識義方，且懼且勸，則調風變俗，不俟終日。"
又曰："憲律之重，由來尚矣。故曹參去齊，唯以獄市為寄，余無所言。路溫舒言'秦有十失，其一尚在，治獄之吏是也'。實宜清置廷尉，茂簡三官，寺丞獄主，彌重其選，研習律令，刪除繁苛。詔獄及兩縣，一月三訊，觀貌察情，欺枉必達。使明慎用刑，無忝大《易》；寧失不經，靡愧《周書》。漢來治律有家，子孫並世其業，聚徒講授，至數百人。故張、於二氏，潔譽文、宣之世；陳、郭兩族，流稱武、明之朝。決獄無冤，慶昌枝裔，槐袞相襲，蟬紫傳輝。今廷尉律生，乃令史門戶，族非鹹、弘，庭缺於訓。刑之不措，抑此之由。如詳擇篤厚之土，使習律令，試簡有徵，擢為廷尉僚屬。苟官世其家而不美其績，鮮矣；廢其職而欲善其事，未之有也。若劉累傳守其業，庖人不乏龍肝之饌，斷可知矣。"
又曰："樂者動天地，感鬼神，正情性，立人倫，其義大矣。按前漢編戶千萬，太樂伶官方八百二十九人，孔光等奏罷不合經法者四百四十一人，正樂定員，唯置三百八十八人。今戶口不能百萬，而太樂雅、鄭，元徽時校試千有餘人，後堂雜伎，不在其數，糜廢力役，傷敗風俗。今欲撥邪歸道，莫若罷雜伎，王庭唯置鍾虡、羽戚、登歌而已。如此，則官充給養，國反淳風矣。"
又曰："論儒者以德化為本，談法者以刻削為體。道教治世之粱肉，刑憲亂世之藥石。故以教化比雨露，名法方風霜。是以有恥且格，敬讓之樞紐；令行禁止，為國之關楗。然則天下治者，賞罰而已矣。賞不事豐，所病於不均；罰不在重，所困於不當。如令甲勛少，乙功多，賞甲而舍乙，天下必有不勸矣；丙罪重，丁眚輕，罰丁而赦丙，天下必有不悛矣。是賞罰空行，無當乎勸沮。將令見罰者寵習之臣，受賞者仇讎之士，戮一人而萬國懼，賞匹夫而四海悅。"
又曰："籍稅以厚國，國虛民貧；廣田以實廩，國富民贍。堯資用天之儲，實拯懷山之數；湯憑分地之積，以勝流金之運。近代魏置典農而中都足食，晉開汝、潁而汴河委儲。今將掃辟鹹、華，題鏤龍漠，宜簡役敦農，開田廣稼。時罷山池之威禁，深抑豪右之兼擅，則兵民優贍，可以出師。"