中醫的發病學認為，疾病在“正邪相爭”、“正不勝邪”的發生、發展過程中，由於邪氣侵入機體有其一定的途徑，“正”與“邪”兩者之間的力量對比亦有其盛衰消長的變化，因此在整個疾病的發生髮展過程中就產生了各個不同的發展階段，而在發病途徑、病變部位以及疾病的傳變等方面，都存在著發生、發展的一般規律。
發病途徑及病變部位
中醫發病學認為，疾病的發生途徑，大致有如下幾方面：
１．病由外入：主要是指病邪由外侵襲機體。其侵襲途徑則有由皮毛而經絡而臟腑，或由口鼻而入及染易等方面。
所謂病邪由皮毛而侵襲機體：即如《素問·調經論·皮部論》所論：“風雨之傷人也，先客於皮膚，傳入於孫脈，孫脈滿則傳入於絡脈”，“絡脈滿則注於經脈，經脈滿則入舍於臟腑也”。傷寒病的“六經傳變”，即是由表入里，由皮毛而經絡入臟腑而發病，並以太陽、陽明、少陽、太陰、少陰、厥陰順序進行傳變。
所謂病邪由口鼻而入：此即是溫熱病的發病途徑，即如葉天士《溫熱論》所謂“溫邪上受，首先犯肺”之類，包括了現代臨床常見的多種呼吸道或消化道傳染病的傳染途徑在內。
所謂“染易”發病：即病邪傳染互易於人，說明傳染之邪為病，與傷於風寒之邪為病不同，其最大的區別就是可以相互“染易”，甚至造成流行。“染易”發病，一般可歸納為空氣相染、飲食相染及接觸相染等途徑。
同時，古代醫家還認識到能夠影響染易的因素，除了疫病病邪致病毒力的強弱、正氣的盛衰外，還與氣候的反常有關。
2．病由內生：主要是指精神刺激、飲食、房室、勞逸所傷，以及年老體衰等因素作用於機體，導致機體對周圍環境的適應能力低下，從而使臟腑組織陰陽氣血的功能發生失調、紊亂或減退，因而導致病由內生。如《靈樞·口問》說：“陰陽喜怒，飲食居處，大驚卒恐，則血氣分離，陰陽破敗，經絡厥絕，脈道不通，陰陽相逆，衛氣稽留，經脈空虛，血氣不次，乃失其常。”
3．外傷致病：主要即是指跌仆、刀槍、蟲獸傷等意外損傷，則可使機體皮肉、經絡破損，氣血虧耗，同樣亦可以導致臟腑組織陰陽氣血功能紊亂而發病。
疾病的發展與傳變
中醫發病學認為，人體皮表肌肉與內臟之間、各臟腑組織器官之間，都是通過經絡系統作為聯絡通路而發生影響的。因此，在疾病的發展過程中，發生於機體任何一個部位的病變，都可以通過經絡發生表里、上下及臟腑之間的傳變。
１. 表里相傳：病邪侵入機體，常由皮毛肌表通過經絡而由表傳里，再傳至臟腑。另一方面，體內臟腑發生病變後，其病邪亦可由里達表，在體表皮膚出現各種不同的病理反應。例如麻疹病證之皮疹外透，即是疹毒由里達表的體現。
2. 上下相傳：不同性質的外邪，常由機體或上或下的不同部位，循其不同途徑而侵襲機體。如《靈樞·百病始生》說：“清濕襲虛則病起於下；風雨襲虛，則病起於上。”故傷於風者，上先受之；傷於濕者，下先受之。但是，人體是一個有機整體，邪侵部位雖有不同，但是依然可以通過經絡發生上下傳變，反映出整體的病理反應和證候。故《素問·太陽陽明論》說：“陽病者，上行極而下；陰病者，下行極而上。”
3. 臟腑相傳：所謂臟腑病變：主要是臟腑功能的失調或障礙，主要反映為功能的太過或不及兩方面。臟腑病變又可通過經絡的聯繫，彼此發生影響，一般有如下幾種可能。
① 一髒功能太過可以影響及相關臟腑，從而使該臟腑功能失調。
② 一髒功能不足可以使另一髒功能失調或不足。也可以由於一髒功能不足，制約它髒能力減退，從而導致另一髒功能偏亢。
③ 一髒病變可循經傳於與其互為表里的臟腑，從而使該髒功能也發生紊亂。