如何應對綜合素質評價遇到的挑戰，真正發揮綜合素質評價促進學生髮展的激勵功能，應該從多方面進行努力。
學校要充分發揮新課程實驗主力軍的作用，主動承擔起使學生、家長和社會認同新課程理念的任務
一是利用家長會、告家長書、社會媒體等途徑，把綜合素質評價的背景、宗旨、目的、實施方式、可能出現的問題及解決辦法向家長解釋說明；二是對家長進行培訓，幫助他們完成綜合素質評價中的家長評價部分；三是陽光操作，定期開展學生綜合素質評價開放日活動，邀請家長參加，使其目睹學校舉行評價的操作流程，專門設定家長活動的板塊，讓家長參與，真正使家長成為重要的評價主體；四是邀請部分熱心的家長擔任監督員，主動地把整個評價過程置於家長和社會的監督之下。只有這樣，家長和社會才能增強搞好評價的信心，自覺維護評價的純潔性。各級教育行政部門要加強對綜合素質評價的檢查與監督，教育督導部門也要及時作出督導評估。
使綜合素質評價的的六個方面真正成為學生髮展的坐標，細化六方面的內容，使其具有規範性、引導性和可操作性
為此，學校應該做到：首先，健全組織，加強制度建設，做到綜合素質評價工作專人負責，專人落實到位，有專門的時間保障；其次，認認真真地學習新課程理念，牢牢把握綜合素質評價的設計目的，做到有關行政部門、教師、學生、家長、社區等評價主體的結合，量化評價與質性評價的結合，學生間的橫向比較與被評學生個體的縱向評價的結合，回顧總結過去與立足學生未來發展的結合；第三，學校要制定好科學的綜評實施細則，發動廣大學生、教師、家長一起參加，共同研討，集思廣益，使實施細則具有很強的引導性、對比性、激勵性、可操作性，使實施細則真正成為學生成長發展的標竿，成為評價的一把無可非議的尺子；第四，堅持以事實為依據，既要看到學生新課程評價促進學生髮展的一面，又要認識到新課程評價並不是萬能鑰匙，仍有少數學生在紀律、品德、行為習慣等方面存在差異性和落後的一面。因此，我們要以“成長記錄袋”的實證性材料為基礎，結合其他的觀察評價方式，如口頭評價、即時評價等多種評價方式，使綜合素質評價反映出學生成長的全貌。
引導學生關注自身的點滴進步，並從中獲得不斷前進的動力和信心，形成積極的人生體驗和自覺的學習態度 事物的變化發展都是從量變到質變的，從某種意義上說，學生的成長也是一個從量變到質變的連續不斷的過程。因此，綜合素質評價應該幫助學生積累自己的成長曆程和人生閱歷，教育學生“勿以善小而不為”，引導學生把自己在六個方面的微小進步、成功的探求、點滴的感悟記錄下來。以往對學生的評價，往往語焉不詳，失之於籠統模糊，消解了學生個性特徵，千人一面，千人一腔。事實上，只要我們仔細觀察，青少年學生尤其是高中生，他們思想、道德、心理等方面的個性特色是十分鮮明的。因此，綜合素質評價應該深刻挖掘學生的個性特點，把握住學生的人格核心，選準評價的角度，採用樸實的敘述性語言，尤其要使用外顯性的行為動詞，逼近學生的心靈本質，準確描述品格特徵，指出學生的學習能力和潛能，並給學生的能力層級以精準的定位。綜合素質評價做到以敘代議，並不是要求我們評價者就事論事，只就學生現狀而平鋪直敘，而要看到學生的未來發展前景，為學生的發展留有適度的空間，給予建議和指導。總之，準確反映學生的鮮明的個性特徵。
避免學生及家長把綜合素質評價當成另一種聯考，要把每一次評價都變成下一次評價的開端，激勵學生不斷進步 要化“收”為“放”，緊緊咬住，環環扣住，使每一學段、學期、學年的綜合素質評價成為鏈條。其中，必須引導學生設計好“立志達標”的計畫表，突破以前等第成績的行動方案，尤其要注意督促學生對某一階段的綜合素質情況進行反思總結，並在此基礎上，再訂立行動方案，這樣就使得綜合素質評價成為學生不斷反思過去、克服不足、改進提高的行動指南。 學生綜合素質評價是新課程背景下產生的新生事物，而它被納入聯考，作為高校錄取的依據之一，更是以前聯考工作中所沒有遇到的問題，應該正視面臨的種種挑戰，竭盡全力去化解它，使學生的綜合素質評價發揮應有的作用。