礦物類中藥的鑑定，在我國許多本草里都有記載，特別是宋代出現了多種鑑定方法，當時已能用礦物的外形、顏色、比重以及物理、化學方法來鑑別真偽與優劣。如《圖經本草》載有“綠礬石”的鑑定方法是：“取此一物，置於鐵板上，聚炭封之，囊袋吹令火熾，其礬即沸流出。色赤如融金汁者，是真也”。
目前，礦物藥的鑑定，一般採用以下方法：
1. 外型鑑別
外形明顯的中藥，首先應根據礦物的一般性質進行鑑定，除了外形、顏色、質地、氣味等檢查外，還應注意其硬度、解理、斷口、有無磁性及比重等的檢查。
2. 顯微鑑別
以細粒礦物集合體的礦物藥可以顯微鏡幫助鑑定，觀察其形狀、透明度和顏色等。
在礦物的顯微鑑別中，透明的利用透射偏光顯微鏡（簡稱偏光顯微鏡），不透明的利用反射偏光顯微鏡觀察其形態、光學性質和必要的物理常數。這兩種顯微鏡都要求礦物磨片後才能觀察。
光是一種電磁波，其電磁振動垂直於傳播方向。根據振動的特點，可把光分為自然光與偏光。自然光是一切普通光源所發現的光波，如太陽光、燈光等。其振動特點是在垂直於光波傳播方向的平面內，各方向上都等振幅地振動。
如果一束光中，光振動只有一個固定方向，稱為偏振光。偏光顯微鏡鑑定法主要依據礦物以下光學性質：
當光波由一種介質傳到另一種介質時，在兩各介質的分界面上將產生反射和折射。對摺射而言，第一（入射）和第二（折射）介質的特徵，可用光波在該二介質中的傳播速度之比──相對摺射率表征。故折射率是鑑定透明礦物的可靠常數之一。
對晶質礦物來說，折射率是受其對稱性控制的。即光波在等軸晶系晶體中傳播時，雖然發生折射，但其折射率不因光波的振動方向不同而發生改變；在其他晶系晶體中，其傳播速度隨振動方向不同而發生變化，因而其折射率也因振動方向不同而改變（沿特殊方向射入者除外）。
利用偏光顯微鏡的不同偏光組合（單偏光、正交偏光、正交偏光加聚光）及附屬檔案（檢板等），觀察和測定上述折射率和晶體對稱性所表現的光學特徵和常數，可用來鑑定和研究晶質礦物藥。
單偏光鏡下觀測的特徵：在單偏光鏡下，觀測的是礦物的某些外表特徵，如形態、解理、顏色、多色性、突起、糙面等。
正交偏光鏡下觀測的特徵：同時用振動方向互相垂直的兩個偏光鏡，可觀測到消光（視域內礦物呈現黑暗）及消光位、干涉色及色級、雙晶特徵等。
錐光鏡下觀測的特徵：用正交偏光加上聚光鏡的組合來觀察干涉圖，確定礦物軸性、光性正負；估計光軸角（2v）大小。
偏光顯微鏡下鑑定礦物藥，是利用薄片和碎屑來進行的。用碎屑時將藥材的細小顆粒置於載玻片上，蓋好蓋玻片，並且往載玻片與蓋玻片之間滴入水或浸油，即可觀察有關光學性質。若利用薄片進行鑑定，就需要專門磨製薄片。
薄片是將標本用切片機切下一小塊（大小一般為2×2cm2；藥材薄片多根據具體情況儘量加大），先把一面磨平，用加拿大樹膠把這一平面粘在載玻片（大小為25×42mm2或更大，厚為0.1mm～0.2mm）上；再磨另一面，磨到厚約0.03mm為止。用加拿大樹膠把蓋玻片（大小為15×15～20×20mm2或更大，厚為0.1～0.2mm）粘在它的表面。因此，薄片是由很薄的礦物藥切片、載玻片與蓋玻片組成的。礦物切片的頂部和底部都塗有加拿大樹膠。
應當注意，由於磨製薄片用的是金剛砂，無論這種金鋼砂多細，薄片表面總會磨出許多溝痕，而不是絕對平滑的表面。有的樣品，在磨製薄片時，須進行一些特殊處理。例如鬆散（土狀、多孔狀等）的樣品，須先將樣口浸在加拿大樹膠中煮過，加以粘結，然後切磨製成薄片。對於那些溶於水的樣品（如大青鹽），在研磨時不能用水，製片的全部過程中，可用機油或松節油代替水。
3. 物理、化學方法鑑別
一般的理、化分析方法，能對礦物藥的成分定性和定量。對外形及粉末無明顯特徵或劇毒的中藥，如玄明粉、信石等尤為必要。《中華人民共和國藥典》（1995年版）還規定了一些礦物藥的含量測定，如雄黃、白礬、芒硝等。
隨著現代科學技術的迅速發展，國內外對礦物藥的鑑定已採用了許多新技術。如用ｘ射線衍射法分析龍骨的成分；用熱分析和ｘ射線螢光分析，研究了滑石的成分；用原子發射光譜分析測定龍骨中的元素；用固體螢光法和比色法測定龍骨中放射性元素鈾的含量等。
光譜分析和ｘ射線光譜分析用於礦物的鑑定和研究，能快速、準確地定性和定量。對很細小的膠態礦物還可用電子顯微鏡進行觀察。這些先進的分析技術的套用，不但使礦物的成分和含量能很快測定，而且對含有的其他微量元素，特別是有害元素也能進行檢測，這對保證用藥的安全和有效是十分重要的。