空間效應和鹼性的關係
生物鹼分子的構象及氮原子附近的取代基的種類等立體因素也常影響氮原子接受質子的難易，故也影響生物鹼的鹼性。如東莨菪鹼的鹼性（pka 7.50）比莨菪鹼的鹼性（pka9.65）弱，既是由於東莨菪鹼分子中氮原子附近6、7位氧橋的空間位阻作用。
分子內氫鍵和鹼性的關係
生物鹼孤電子對接受質子生成共軛酸，該共軛酸的穩定性影響生物鹼的鹼性。[10-羥基二氫去氧可待因]。
分析生物鹼鹼性強弱時，應綜合考慮，因為上述影響因素不是單一存在的。一般誘導效應與共軛效應共存時，共軛效應的影響大；空間效應與誘導效應共存時，空間效應的影響大。