一、烹飪講究火候和色香味。有的食品如牛肉、羊肉、蛋糕等用微波爐加工時，由於加熱時間太短，所產生的易揮發性化合物，僅為傳統加熱方式的1/3，味道明顯不足，蛋糕缺少堅果和焦糖味，牛肉、羊肉等食品則帶焦煳味和辛辣魚腥味。因此，應儘量用中低擋溫度加熱、時間長些，這樣可使不良化合物氣味揮發掉。
二、微波爐內應經常除異味。用微波爐烹飪氣味較濃的韭菜、蔥、蒜等食物後，爐腔內往往會產生異味，影響下一道菜的味道，這樣就必須對爐腔進行清潔。可用一隻微波爐專用器皿，盛上一半清水，再加入少許檸檬汁或食醋，將其放入爐內。用高溫擋煮至沸騰後再煮片刻，待器皿內水稍冷卻後取出，再用毛巾擦拭爐腔四壁。這樣就可以除去爐內的異味，不影響下一道菜的味道。
三、包裝食品應去殼加熱。微波爐最高溫度可達200℃以上，在高溫下，包裝材料中的添加物如粘合劑、聚合物等，會大量滲入所烹飪的食物中，微波更加可以穿透塑膠包裝，使塑膠中的低聚苯成分溶進食物中。所以，像塑膠腸衣包裝的香腸肉製品等，加熱時應除掉外皮，放在微波爐器皿中加熱烹飪最安全。
四、適當除脂以克服膠粘現象。用微波爐烘烤食物時，往往會出現像一般傳統烹飪產生的膠粘現象。此時可將烘烤食物脂肪去除一部分，再用少許奶油或橄欖油，膠粘現象即除，還可增加食物的光澤和香味。
五、掌握好水量和食品體積。新鮮的食物或需要較長時間煨、燒、烘、烤的食物，微波爐烹飪所用水量，只取一般傳統烹飪的2/3即可。用微波爐烹飪肉類或果實型蔬菜(如土豆、胡蘿蔔等)，切得越均勻越好，這樣烹飪出的菜餚才能色香味俱佳。
六、炒瓜子等堅果注意火候。將生瓜子、花生、松子、榛子等堅果，均勻攤平放在微波爐內的玻璃盤上，以中擋加熱，中間停爐翻動幾次，3分鐘左右聽到咔咔聲，果皮裂紋，待響幾秒鐘後即已炒熟，應及時停爐。晾一會兒就可食用了。
七、利用微波爐擅長再加熱的功能。因為微波爐的主要功能是翻熱功能，它最擅長再加熱，所以用燒烤功能燒烤食物時，應先用微波把食物做到七成熟，再進行燒烤，避免外焦內生，這樣做出的佳肴才能色香味俱佳。
八、不能先放過多的糖和鹽。微波爐加熱的食物不能先放進過多的糖和鹽，否則大量的糖和鹽會改變食物吸收微波爐能量的方式，使微波爐不易殺死食物病菌