轉基因是大自然中每天都在發生的事情，只不過在自然界中，基因轉移沒有目標性，好的和壞的基因都可以一起轉移到不同的生物個體。人為控制轉基因本是科技的進步，但當這些轉基因成果端上餐桌，卻使人們聞之色變。
普通大眾認為轉基因吃不得，首先源於人類的慣性思維和科普的缺失。自20世紀70年代遺傳工程誕生以來，人們對轉基因的恐懼就一直存在。在《紐約客》上，曾有專家分析，對轉基因產品的不信任來自人類一種古老的非理性的直覺，即自然的就是好的，非自然的就是壞的。現代社會科技進步，科普不到位，人們依然會依賴這種自身的直覺。因為對轉基因了解的不多，就會認為轉基因屬於高科技，不確定因素太大，聽到其負面信息也無法通過現有知識分析判斷。抱著寧可信其有不可信其無的心態，民眾就多會拒絕轉基因。
其次，轉基因可能帶來的風險使民眾認為轉基因吃不得。儘管美洲對轉基因技術使用已久，儘管迄今為止沒有轉基因危害人體健康的證據，但並不等於這些危害就不存在。對一項大型科學研究得出定論要等十幾、甚至幾十年，到那時福禍才見分曉。如果有危害，帶來的影響也是極為深遠的。並且轉基因食品短期試吃與長期作為主食食用效果也完全不同。例如中藥可以治病，但中藥卻不能如主食般天天服用。
再次，大量打著轉基因旗號的不實報導，也讓民眾相信轉基因吃不得。例如2005年5月22日，英國《獨立報》披露了轉基因研發巨頭孟山都公司的一份秘密報告。報告顯示，吃了轉基因玉米的老鼠，血液和腎臟中會出現異常。孟山都公司迫於壓力公布了完整試驗報告，歐盟分析後認為其並不會對人和動物健康造成負面影響。再如2024年9月21日，《國際先驅導報》報導稱，“山西、吉林等地因種植‘先玉335’玉米導致老鼠減少、母豬流產等異常現象”。但經核實，山西等地從來沒有種植和銷售轉基因玉米。
此外，受貿易利益衝突等的影響，一些國家的政府和集團利用轉基因名號進行負面宣傳，打壓轉基因產品，大打貿易戰，也使公眾不敢食用轉基因食品。