三是監管力度不夠。對養殖戶違規排放、乾濕分離不徹底等現象，目前還缺乏村規民約等約束機制，還缺乏有效的行政監管手段，對違規排放的處罰沒有跟上，致使養殖污染治理成效還不明顯。
四是收集體系尚不完善。目前全市只有部分重點養殖戶和重點養殖區域建立了相應的乾糞收集體系，規模豬場實施乾糞收集的比例仍然較低，主要是就地綜合利用的途徑不多，傳統的種植結構限制了綜合利用的出路。農戶使用畜糞收集加工後的有機肥的積極性不高，有機肥還難以得到廣泛推廣與套用。
五是新技術的引進套用還存在差距。現有的治污方式還停留在沼氣池治污模式上，對引進與推廣套用畜禽排泄物治理新技術、新模式（如生態型、發酵型、零排放等模式）的力度還不夠。
加強畜禽養殖業污染治理是一項長期而艱巨的任務，在肯定治理成效的同時，要清醒地看到存在的差距，樹立農村生態環境的憂患意識，以發展循環經濟、推進節能減排的理念，改變純粹為治理而治理的錯誤思想，將加強畜禽污染治理作為轉變農業發展方式、改善我市環境質量、營造和諧生態環境、保障民眾身體健康的重要抓手，乾字當頭，一抓到底，抓出成效。
二、統一思想，自覺行動，深刻認識畜禽養殖業污染治理的重要性
（一）加快畜禽養殖業污染治理，是貫徹落實科學發展觀在農村工作的具體體現。（略）
（二）加快畜禽養殖業污染治理，是保護水資源、保障人民飲用水安全的迫切需要。（略）
（三）加快畜禽養殖業污染治理，是保障畜牧業可持續發展的重要舉措。（略）
（四）加快畜禽養殖業污染治理，是生態市建設的一項基礎工程。（略）
三、突出重點，分步實施，全面推進畜禽養殖業污染治理六大工程
（一）全面推進“兩分離三配套”工程。對生豬存欄50頭以上規模豬場和規模奶牛場，要嚴格執行畜糞乾濕分離、雨污分離和沼氣池、沼液貯存池、乾糞堆積棚等“兩分離三配套”標準。具體任務是：1.50頭以上規模豬場的沼氣池建設任務，今年要全部完成；2.存欄200頭以上的規模豬場“兩分離三配套”建設任務，今年要全部完成；3.存欄100-199頭的規模豬場“兩分離三配套”建設任務，今年要基本完成，其中列入省811工程的37個規模豬場今年必須完成；4.明年全部完成50頭以上規模豬場“兩分離三配套”建設任務。各鎮、街道要根據市里制訂的具體工作計畫，有針對性地制訂年度實施計畫，抓緊落實工作任務。同時，市和鎮、街道要分別抓好幾個標準較高的規範化示範場建設。
（二）全面推進散養戶整治工程。曹橋街道野馬村生豬散養重點區域整治，今年要完成；曹橋街道、新埭鎮、廣陳鎮、林埭鎮等4個生豬散養重點區域整治，明年要完成。涉及鎮、街道和市有關部門要加強工作指導和工程監管，確保整治任務保質保量完成。
（三）全面推進水禽築塘養殖厭氧治污工程。對水禽存欄500羽以上規模禽場實施上岸築塘養殖厭氧治污，水禽排泄物治理要按照乾濕分離的要求，進厭氧池進行處理，嚴禁河道養殖水禽，到XX年規模水禽場治理率達到100%。
（四）全面推進農牧結合綜合利用工程。就地綜合利用是整個畜禽養殖業污染治理中最有效、也是最經濟的一種治理方式，要在開展“兩分離三配套”治污標準建設的同時，積極推廣農牧結合、林牧結合，實施就地綜合利用。規模養殖場周邊有條件的，要通過土地流轉、租賃等方式鼓勵發展林牧結合生態畜牧業，力爭各鎮、街道有30%以上規模畜禽場實施農牧、林牧結合、綜合利用。