在國內，法律規定只有金融機構才有權利吸納代理用戶的錢，其他企業和機構不得從事類似的活動。但由於第三方支付平台出現不久，而且交易數額仍顯不大，所以目前還沒有相應金融監管法規和機構管理。專家認為，目前我國對電子支付方面的法律法規仍顯單薄，由於數額較小，網上支付還沒有引起一些金融監管部門的重視。但網上支付現在正處在高速發展時期，交易額在短期內也可能會有較大的增長。目前這個時期，是建立監管體系的最佳時機。
（2）電子貨幣發行合法性有待確定
目前許多網上支付平台實際上發行了某種形式的電子貨幣，客戶以法定貨幣購買電子貨幣後即能用該電子貨幣購買註冊在相應電子商務企業的不特定賣家提供的商品或服務，從而使該電子貨幣具有了廣泛的支付能力。同樣，手機支付使手機充值卡具備了電子貨幣的功能。而對於這種電子貨幣，儘管從國際電子支付業務發展趨勢來看，基於網路發行的電子貨幣將成為今後電子商務中的重要支付工具，但由於目前國內缺乏對其性質、發行主體、使用範圍等方面的法
律規定，其合法性有待明確。
（3）第三方機構提供支付結算服務，突破了現行特許經營限制許多支付服務機構為交易雙方開立賬戶，並通過充值賬戶後以電子貨幣為載體進行賬戶間的支付結算，完成交易款項劃撥。這種行為在事實上突破了商業銀行“結算”業務和“代理收付款業務”專營的法律規定。此類業務的進一
步發展特別是當其達到一定規模後，勢必對銀行支付結算業務產生影響。
（4）加大資金非法轉移監管
由於對網上交易的真實交易背景難以查證，網上支付平台有可能成為不法分子資金非法轉移、套現資金的便利工具。買賣雙方通過製造虛假交易，利用網上支付平台順利完成資金轉移，從而達到非法交易的目的（如洗錢、賄賂、非法回扣等）。比如，目前大部分的網上支付是基於銀行卡完成的，買賣雙方可以通過製造虛假交易，由買方通過信用卡透支消費，賣家收到款項後變現，從而達到非法套現的目的。信用卡套現具有較大風險，國內商業銀行對信用卡取現有較嚴格限制並收取較高的費用，而通過網上支付平台則使持卡人非常便利地繞開了發卡行管制，以一般消費方式達到了預借現金的目的，如果該方式被廣泛利用，信用卡套現金額過高，很有可能引發金融風險。
3.市場規範問題
（1）缺乏市場準入標準
根據有關數據顯示，目前國內提供第三方支付服務的機構已經發展到50餘家。在國家政策和經濟環境的推動下，網上支付服務產業呈現出良好的發展趨勢。於是，在短短一年內，第三方服務機構出現了爆炸式增長。而這些機構因為技術實力和經濟實力的區別，提供的服務良莠不齊。目前，有些支付服務商開始著眼於“價格秀”，使整個市場看起來熱鬧而又顯得有些無序。無序的競爭將影響產業的發展，影響服務的質量，而且存在潛在的金融風險。因此，為了保證支付產業的健康發展，為電子商務解決支付瓶頸，專家建議政府相關部門抓緊建立支付市場的準入制度，提高整個支付產業的服務水平和競爭力。
（2）缺乏相應法律法規
目前，具體到為電子商務服務的網上支付業務，法律上基本還是一個空白。傳統的支付結算規則在網上支付業務規範中有一定的作用，但局限性很大。另外，目前涉及網上支付的法律只有《電子簽名法》（解決了類似傳統結算業務中籤章的問題），規章有人民銀行發布的《網上銀行業務管理辦法》、銀監會的《電子銀行業務管理辦法》和人民銀行的《電子支付指引》，除此沒有其他規範。如果從我們近期討論的為電子商務服務的網上支付問題來看，法律制度上幾乎一片空白。法律法規的缺失，導致政府機構對目前從事網上支付業務的這些機構和他們的業務要不要監管，要不要有一定的規則去規範缺乏統一標準。正是因為法律法規建設的滯後導致了網上支付存在的一系列問題。包括安全問題、金融監管問題、消費者權益保護問題等等。