2、制訂和完善綜合性發展規劃，充分發揮規劃的指導和統籌作用
提高支農資金使用效率必須規劃先行。建議各涉農部門深入調查研究，根據本縣實際和本部門管轄範圍，制訂水利、農業、林業、交通、生態建設等領域的中長期發展規劃，提出發展的指導思想、戰略重點、總體布局和重點建設項目。縣整合支農投資領導小組根據各部門的發展規劃，制訂和完善縣級綜合性發展建設規劃，規劃要統籌全縣，相互銜接，重點突出，避免重複，對一些重大項目要編制項目建議書、可行性研究報告和初步設計。在規劃的指導下，今後所有渠道的支農投資和項目的編報、實施，都按照規划進行統籌安排，避免項目申報和實施過程中的盲目性、片面性、偏離性和照顧性。
3、規範項目管理程式，嚴格項目管理辦法
針對各部門資金管理辦法各一的現狀，縣領導小組對各管理辦法進行集中梳理，制訂統一的涉農項目管理程式和辦法，在項目管理上做到“四制”，即項目法人制、招投標制、工程監理制、契約管理制；把好“四關”，即項目規劃設計關、工程施工關、資金使用關、工程驗收關，使每個項目成為高標準建設工程。凡政府下撥的支農投資一律由縣財政管理，縣財政按工程項目進度撥付項目資金。項目一經批准下達，就必須嚴格按計畫進行實施，不得擅自變更建設地點、建設內容，確需調整項目的必須由項目建設單位向涉農投資領導小組申報審定。
4、明確部門職責，加強項目監管
縣整合支農投資領導小組要負責項目的協調、溝通；各行業主管部門要加強行業的規劃和管理，加強項目實施的技術指導和檢查監督；財政部門要加強資金的預算安排、項目的資金撥付和監督，保障資金的安全運行；審計部門要加強項目資金的審計監督力度。所有涉農項目資金都要建立專戶，實行專戶儲存、專款專用。項目建設單位要嚴格控制項目支出，嚴禁開支與項目建設無關的費用，不得隨意突破項目資金預算，以免影響工程的如期順利實施。
5、創新支農投資管理體制。
鼓勵和支持社會投資參與涉農建設，要進一步改善投資環境，充分發揮政府支農投資的指導作用，改變目前單一的、直接的、無償的政府支農投資方式，吸引社會投資，鼓勵和支持非公有制經濟等各種經濟成份從事農業建設。積極探索小型項目實行“以獎代投”的有效辦法，按照“誰投資、誰管護，誰受益、誰所有”的原則，改善農村基礎設施產權制度，明確產權職責，加強建後管護，解決產權不清、管理不善、效率低下等問題，提高支農投資使用效益。