近年來，通過開展“xxxx”重要思想學習教育、保持共產黨員先進性教育活動，農村黨員幹部的思想素質、科學文化素質、帶頭致富和帶領民眾致富的能力明顯提高，黨員長期受教育的機制基本形成並不斷得到健全。但是，隨著農村改革的不斷深入，農業和農村經濟的不斷發展，欠發達地區農村黨組織和黨員適應性不夠和管理工作滯後的問題也日益顯現，當前農村基層組織黨員教育中存在一些突出的、帶有普遍性、傾向性的問題，影響和阻礙了農村基層組織工作整體水平的提高，在一定程度上也影響和制約了農業和農村經濟又好又快發展。
一、存在的問題及原因分析
1、學習教育重視不夠。一些農村基層黨組織和黨員領導幹部重經濟而輕黨教。抓經濟大張旗鼓，勁頭十足；抓黨員教育則心虛氣短，應付了事，生怕沖淡甚至干擾了經濟建設這箇中心工作。就是在農村基層黨的建設工作中，大多工作指標明確而鋼性，而黨員教育工作指標則較為模糊，相對虛化，致使黨教工作存在程度不同的形式主義傾向。這些思想認識在工作中的具體表現，就是對農村黨員教育工作領導不力，活動開展不力，督促檢查不力。
2、學習教育組織不易。一是組織集中學習活動不易。部分村沒有學校，也沒有村部，沒有一個可以集中開展活動的場所，組織集中活動時，往往需要借農戶的房子做活動場地，開展集中學習活動很困難。二是農村無職黨員教育不易。農村家庭聯產承包責任制實行以來，農村黨員特別是無職黨員與村支部的聯繫較為鬆散，沒有以前那么緊密。人員難集中、教育難開展的情況，在農村無職黨員中普遍存在。三是流動黨員教育不易。目前，欠發達地區農村流動黨員流動性大，工作地點不固定，難覓蹤跡，對這部分黨員的教育往往存在盲點。四是老齡黨員教育不易。當前，欠發達地區農村黨員老齡化問題較為突出。大部分農村老黨員文化普遍較低，思想保守，觀念陳舊，少數生活艱難，對這部分黨員的教育往往事倍功半或根本無法落到實處。
3、學習教育針對性不強。欠發達地區農村部分黨員中存在的問題表現在，有的黨員不能積極宣傳貫徹黨在農村的新政策，創新意識不強，觀念陳舊，致富思路不明，辦法不多；有的黨員宗旨意識淡薄，不願做服務民眾的工作；有的黨員法制觀念不強，違法違紀，損害黨在民眾中的形象，等等。但農村基層黨組織在對農村黨員的教育工作中，往往很少從上述表象中仔細查找思想根源，也很少根據查找出的思想問題進行有針對性的教育。一是教育內容針對性不強。如，目前農村黨課除報紙刊載文章、電視播出節目外，較少有通俗易懂、形象直觀的學習資料，對反映新時期中央一系列惠農強農政策、對改革開放過程中湧現出來的黨員致富典型、對信念堅定、廉潔奉公、一心為民的優秀黨員事跡等課程設定過少，致使黨員教育空洞化和抽象化。農村黨課內容設定存在與市場銜接不緊、培訓資料過時過濫等問題。輕特色種養技術教育，輕標準生產技術教育，輕職業技能教育的情況普遍存在。黨員教育工作中對黨員權利意識、規則意識、健康生活意識教育缺乏。二是教育形式針對性不強。以會代訓多，集中專門培訓少；讀理論文章、念黨報多，實際操作少；關門培訓多，外出參觀考察學習少，缺乏農業、農村、農民特色和新意。
4、學習教育機制不活。欠發達地區農村黨員教育工作缺乏系統性。在黨教方面，基層黨的組織、宣傳、紀檢等部門都負有責任，各有側重。但從實際操作看，三個職能部門在協調、配合上有待加強，存在內容上重複、時間上交叉的情況。此外，農村黨員教育經費不足，在一定程度上制約了黨員教育工作正常開展。稅費改革後，大多數村靠上級財政的轉移支付來發放村幹部的工資和支付辦公經費，日常運轉困難，加上不少村存在負債，基本沒有支部活動專項經費。絕大多數的村黨支部開黨員會發放誤工補貼，從5元-10元/天不等，開一次會至少要花費三、五幾百元錢。因為缺錢，部分農村基層黨支部只好儘量少組織或不組織活動，能省就儘量省，能簡單就儘量簡單，實屬無奈之舉。