在我們實地調研和對南澳縣海洋與漁業局工作人員採訪中發現，島上沒有專門深加工海產品的加工廠，有的只有初加工的工廠、作坊。我們在後宅鎮西山村參觀了奇佳寶加工廠，該工廠收購當地從當地收曬乾的紫菜，主要做為食品的添加物如餅乾上的海苔，紫菜的質量只要根據廠家的要求選取，一般紫菜的質量不會很高。紫菜的加工過程很簡單，用手把紫菜撕成較小的塊狀後，將其投入到攪拌器進行攪碎。紫菜顆粒的大小，由商家的訂單決定。整個加工過程簡單，沒有任何化學添加物。加工成品主要銷往島外的加工廠進行進一步加工。據廠中負責人介紹，不僅是紫菜，當地的海帶、龍鬚菜等也是直接曬乾或曬乾後再攪碎。
而在位於後宅鎮的前江碼頭的南澳縣水產綜合加工廠則主要對海產品進行冷凍加工。該廠主要的工作為製冰。前江碼頭捕獲的海產品除了部分留在當地銷售外，大多送到該廠進行冷凍保鮮，然後銷往汕頭、福建等周邊地區。
除了專門的加工廠外，當地的小作坊還將海產品如最常見的魷魚直接曬乾，夏天在海邊經常能看到成片的曬魷魚。但當地基本不將其進行包裝而是散賣或運到汕頭再進行包裝。我們訪問了多家的海產店，店長都向我們介紹了，即使一些印有南澳產的漁副產品基本都是當地的海產運到汕頭或周邊地區加工包裝的而不是當地的最後加工成品。
根據我們的調研發現南澳加工流程簡單，海產品基本無添加防腐劑之類化學物，總的來說當地對海產品進行的加工仍停留在初級階段。
3.3現狀分析
當地遠離大陸，受到外源性污染較小。海島這一特殊的地理環境，也為南澳築起天然屏障，同時島上沒有工業廠，所以當地的海產品污染小，肉質鮮美，營養價值高，在周邊地區有良好的口碑，受到廣大人民的歡迎。南澳海產品加工處於初級階段，某種程度上也保持了“鮮”，減少了污染，因此南澳食品相對來說是較為安全的。
但是海產品的加工處於初級階段，特別是冷凍加工，保質期極其有限，使南澳海產基本只能銷往周邊地區，而無法銷往更遠的內陸，不利於打響當地海產品品牌，限制了海產品價格的上限。水產品加工落後已成為制約南澳漁業進一步發展的一個重要因素。眾所周知，深加工比初級加工的利潤多，商品附加值高，而且淨重小於初加工成品，這也將大大減少當地運輸不便帶來的昂貴運輸成本，總的來說，在當地建立深加工廠更利於當地經濟的發展。
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