各地各部門在改革中也遇到了一些問題，一是少數領導幹部“官本位”思想嚴重，認為公車就是“官車”，是權力和地位的象徵，取消公務用車，有損自己的權威和形象，因此缺乏改革的積極性；有的擔心取消公務用車會影響正常工作，因而不願改革。二是有的地方和部門對原有公務用車的處理沒有面向社會公開拍賣，而是出售給本單位領導幹部或司機，並給予一定的優惠，由於缺少透明度，民眾不理解、有意見。三是受經濟發展水平的制約，改革後交通費用的發放標準在地區與地區之間、部門與部門之間以及領導幹部與一般幹部之間存在一定差異，如何科學合理地確定難以把握。
四、對今後工作的建議
從現實和社會的長遠發展看，對公務用車管理制度進行改革勢在必行。當然，實行公務用車制度改革情況複雜，政策性強，涉及面廣，關係到幹部的切身利益，必須積極穩妥地進行。鑒於我國各地經濟發展水平差異較大，行政區域、地理區位不同，公共運輸發展程度不一，社會化服務水平各異，目前不宜在全國推行統一的改革模式。
因此，建議要進一步總結各地各部門的實踐經驗，堅持先行試點，上下結合，採取多種模式，不斷完善，穩步推進，逐步加大改革力度。改革要由政府職能部門牽頭，紀檢監察機關要積極參與，大力推動，認真履行好監督檢查職能，以此促進源頭治腐工作的深入開展。要加快中央和國家機關改革試點步伐，建議國管局、中直管理局和財政部選擇部分中央和國家機關進行公務用車制度改革試點。
在改革中必須堅持和把握以下幾點：
1、要堅持有利於提高工作效率，有利於節約財政開支，有利於社會穩定，有利於促進黨風廉政建設的原則。不能因為改革而影響正常工作和社會穩定。
2、要加強宣傳引導，營造有利於推進公務用車制度改革的社會氛圍。一方面要提高領導幹部對改革工作重要性和必要性的認識，統一思想，轉變觀念，積極推動改革，做改革的領導者；另一方面要充分調動廣大幹部民眾的參與意識和積極性，爭取社會各界對改革工作的理解和支持。
3、對原有公務用車的處理要做到公開、公正、公平，要增加透明度，接受民眾監督，避免“暗箱操作”，防止以權謀私行為的發生。同時要積極穩妥地做好改革後司機的安置工作。
4、各地各部門應結合實際確定改革的範圍，依據經濟發展水平、工作需要和社會承受能力確定交通費用發放標準。要堅持權責利相統一的原則，既要保證正常工作需要，又要避免借改革之機亂髮補貼。
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