96年後，林純忠同志被組織提為副科長、科長，負責科的工作，職務變了，可他的工作精神沒有變，他仍然一心撲在工作上，處處以身作則，率先垂範，用他自己的話說，加班加點是“家常便飯”，帶病堅持工作是“小事一樁”，那裡有困難那裡最繁忙“我不上誰上!”。前幾年，為了解決科人手不足、24小時輪值班與業務量劇增的問題，他以身作則，自覺放棄值班補休、節假日和公休假，三年累積約200天；有一段時間，為了儘快完成關綜合防雷工程方案，他不顧胃病復發，加班加點，每天工作近十四個小時，帶領全組同志，連續奮戰半個月，及時地完成了上級交給的任務；XX年4月到10月，為了完成汕頭海關新辦公大樓計算機、通訊機房的建設和大樓的技術搬遷工作，他不顧“非典”肆虐的危險、夏日酷暑和密閉機房達攝氏40多度的高溫、高分貝噪聲、有害煙氣，堅持親臨工地，了解工程進度，檢查施工質量，解決出現問題，確保了工程按期保質的竣工，兩次機房搬遷過程中，他自始至終都堅持在現場指揮，從系統設備的拆卸、安裝和調試到系統設備的保護、裝卸、搬運的指揮以及大樓搬遷過程的相關技術支持保障工作，均做了周密的安排並落實專人負責，每次都是連續工作近二十個小時；XX年7月，長期與他生活在一起的母親因病住院，病發至今已兩年多了。面對著已經成為植物人的母親，他常常感到內疚、自責和悲傷，但他知道，自己是一名黨員領導幹部，不能因為親情忘了責任，不能因為家事而耽誤了工作。三年多來，他沒有因為母親的病請過一天假，一心一意撲在工作上，夜裡他常常守在母親的病榻，照料生病的母親；白天他依然堅守崗位，履行職責，組織全科做好電子信息系統的日常運行管理工作，確保了汕頭海關各項業務和改革的順利開展。
二、刻苦鑽研業績顯著
計算機前台設備維護工作看起來似乎沒有特別高深的技術，但怎樣做到準確、及時、快捷地發現問題、解決問題，卻是大有學問的，而技術人員綜合素質的高低、發現問題和解決問題能力的大小將直接影響計算機套用工作的順利開展及業務部門的工作。正是意識到自己工作的重要性，林純忠同志十分注重對相關理論知識的勤奮鑽研和知識更新，並在實際操作中不斷總結經驗，多年的摸索，使他對這些設備的性能了如指掌，處理問題得心應手。有一次，關區一個網路節點在搭建後連續正常運行近兩個月時出現不穩定情況，現場業務工作無法正常開展，恰好他出差在外，科里派了幾撥人員，帶了全新的設備，先後趕赴現場處理，均無法解決問題，他出差回來得知訊息後，立刻趕赴現場，運用所學知識，僅用半天工夫，就找到節點故障是由設備老化、穩壓電源失效引起網路設備工作異常所致。這些年來，他為業務現場解決了一個又一個技術難題，成為關區各用戶心目中技術故障處理專家，受到各基層單位的好評。
林純忠同志主持全科工作的前後，正是我關h883/edi等計算機套用工作的不斷普及和深化的時候，原有關區網路的結構和性能已越來越不能滿足套用工作的需要，特別是影響了我關辦公自動化系統的推廣套用，為此，在關、處領導的支持下，他積極組織全科同志，認真分析了我關計算機套用需求，針對關區網路存在的問題，組織擬定了汕頭海關計算機網路改造方案，在網路改造所需設備未到位的情況下，他帶領全科同志，利用現有設備，實施計算機網路改造過渡方案，在短短半年裡，先後完成辦公大樓樓層及偵查分局、調查局及分關、辦事處等10個點的網路改造，滿足了關工作的需要。隨後，他又組織完成汕頭關區計算機網路系統的改造工作，包括核心區域網路的改造、關區廣域線路的提速和關區22個局、分關、辦事處、業務現場計算機區域網路升級換代，大大地提高我關計算機網路性能，為汕頭海關信息化建設再上一個新台階奠定了良好基礎，確保各業務套用項目、辦公自動化系統的推廣套用及通關作業制度改革的順利進行。