XX年下半年，隨著以建立“耳聰目明”的智慧型型海關為目標的現代海關第二步發展戰略的實施，業務改革以及伴隨而來的通關業務系統的轉型換代、風險管理平台的建立等等，對海關信息系統建設及安全運行提出了更高的要求。為此，林純忠同志根據海關總署和我關的部署，先後組織完成了汕頭海關信息系統安全體系的建設；組織完成了《汕頭海關網路安全擴容改造方案》的撰寫、關區計算機網路系統的擴容改造和三網分離工作，組織完成了《汕頭海關網路與信息安全應急預案》的撰寫、技術演練工作；組織完成新辦公大樓機房建設、電子信息系統無故障遷移和大樓搬遷期間技術支持保障工作；組織完成hXX工程平台搭建、大量設備安裝和切換技術保障工作，確保了我關hXX工程的順利上馬等。此外，還組織全科做好關區電子信息系統日常運行管理工作，確保系統長時間無故障運行，為汕頭海關電子信息系統的建設和安全運行做出了突出貢獻。
三、不畏艱難勇挑重擔
汕頭海關地處粵東地區，跨越汕頭市、汕尾市、潮州市、揭陽市和梅州市，屬多雷暴地區，設備因雷擊損壞情況時有發生，特別是最近幾年，情況更加嚴重，計算機系統、通訊系統均先後不同程度受雷擊影響而出現故障或設備損壞，給我關業務工作造成一定影響，對此，97年7月，關黨組決定成立以林純忠同志為組長的關防雷工程小組，負責實施我關辦公大樓綜合防雷工程。在防雷資料嚴重缺乏、無任何借鑑、對綜合防雷了解不足、時間緊、任務重等種種困難面前，林純忠同志沒有畏縮，他帶領小組的同志們找來大樓竣工圖、防雷規範、防雷工程技術等資料，走出去到建築設計院等有關單位搞調研，虛心向大學及氣象部門等防雷專家請教，加班加點，在一個半月內，組織完成對辦公大樓綜合防雷工程方案的比較和初定並參與完成方案的選擇和審定，隨後，又組織完成辦公大樓綜合防雷工程的實施，在他和小組的同志們共同努力下，工程於98年4月初提前竣工並順利通過省市防雷中心的驗收。在完成汕頭海關辦公大樓綜合防雷工程後，根據關防雷的工作部署，林純忠同志又不辭辛苦，先後組織完成了陸豐辦事處等17個分關、辦事處的防雷工程。這些工程由於採用的技術先進實用，工程設計合理，防雷等級高，因此防雷效果非常顯著，明顯改善了我關設備工作環境，大大提高了我關計算機系統、通信系統的安全性和可靠性，在保護我關設備的安全，確保我關各項工作的順利進行方面，取得了顯著的社會效益。在此項工作中，林純忠同志不僅認真做好工程實施的各項組織工作，而且帶頭刻苦鑽研有關防雷工程技術知識，不斷進行工作總結，獨立撰寫了《汕頭海關辦公大樓防雷分析及對策》論文一篇，受到總署有關專家的好評併入選海關係統專業技術職稱評審《優秀論文集》。
原運行及網路科是我關職能部門中員工最多的科室，全科共有幹部17人，承擔我關電子信息系統機房及機房設備、計算機系統設備、覆蓋粵東五市的關區網路和計算機前台設備的運行管理和日常維護工作，工作任務繁重，尤其是XX年，該科還負責網路安全擴容工程、新大樓機房建設和搬遷、hXX工程平台的搭建、大量設備的安裝和切換技術保障、風險管理平台的搭建、陽光海關工程技術支持等多項重要工作。在如此繁重的工作任務面前，林純忠同志毫無懼色、鎮定自若、迎難而上，他一方面緊緊依靠上級的正確領導和支持，團結黨員幹部和業務骨幹，以整頓教育活動、實行關銜制度為契機，加強科的隊伍建設，狠抓規章制度的落實，時刻關注員工的思想動態，開展談心活動，及時化解矛盾，關心員工疾苦，努力搞好科班子團結，不斷增強科集體的凝聚力和戰鬥力。另一方面，針對任務多、工作量大、實時性要求高的特殊情況，林純忠同志認真做好組織和落實工作，他多次召集科領導和業務骨幹開會討論，明確科班子的分工，對各項任務按輕重緩急進行合理安排，並組織科的業務骨幹分別負責，在各項工作的組織實施過程中，林純忠同志特別注重督促檢查、落實和請示匯報，並根據實際情況及時做好本科人員調配和協調工作。由於方法科學、安排得當，該科在人員多、任務重、壓力大的情況下，工作忙而不亂、有條不紊，出色完成全年各項工作任務。