市農業局：負責郊區農作物抗旱、排澇工作。
北京衛戍區：負責駐京部隊參加防汛搶險、抗洪救災等組織協調工作。根據需要擔負防汛搶險、營救民眾、轉移物資等抗洪救災任務。
武警北京市總隊：負責武警部隊參加防汛搶險、抗洪救災等組織工作。根據需要擔負防汛搶險、營救民眾、轉移物資等抗洪救災任務。
北京市電力公司：負責重要防汛設施外圍電網供電保障及電力應急搶險的工作。
北京城市排水集團：負責所屬污水處理廠和所轄的立交橋泵站、雨水管線、污水管線、雨污合流管線及相關附屬設施的防汛搶險，按照保障方案負責雨前、雨中、雨後清掏雨水井，保證排水管線暢通。 北京市自來水集團：負責水廠、供水管網的維護、搶修，確保居民正常用水，負責防汛機動搶險抽排水任務。
北京祥龍資產經營有限責任公司：負責組織協調防汛搶險物資(以鋼材為主)的儲備、供應工作。
北京市政路橋集團有限公司：負責所屬各施工企業施工工程的防汛工作，負責城六區路面、立交橋區及地下過街通道的排水設施汛期排水安全、搶險、搶修。
區縣政府：各區縣人民政府為屬地安全度汛工作的責任主體，對本轄區內預防、搶險、避險、救災等防汛工作負主責。負責做好轄區內重點部位、重要設施等防汛工作，落實各區縣規劃、財政、交通、建設、房屋、市政、水務等各部門以及鄉鎮、街道、辦事處、村的安全度汛責任制，制定屬地總體防汛應急預案，組織應急搶險隊伍，配備必要的搶險物資，做好搶險、救災、人員轉移和安置工作，確保不出現人員傷亡和責任安全事故。負責轄區內防洪排水搶險工作的統一指揮；負責轄區內危舊平房區，山區土石流易發區、採空區(採礦區)，中小水庫、小河道、小塘壩、蓄滯洪區民眾安全避險轉移；負責轄區內城鄉結合部、城中村、棚戶區的安全度汛保障工作；負責轄區內在京中央單位的外圍排水保障工作；加強轄區各單位、民眾的避險自救知識宣傳，提高民眾自我保護能力。
2.2 辦事機構
2.2.1市防汛抗旱應急指揮部辦公室為市防汛抗旱應急指揮部的常設辦事機構，設在市水務局，辦公室主任由市水務局局長兼任。具體承擔本市防汛抗旱突發事件應對工作的規劃、組織、協調、指導、檢查職責。
2.2.2市防汛抗旱指揮中心設在市水務局，並配備相應的設備設施，作為防汛突發事件發生時市防汛抗旱應急指揮部的指揮平台。
2.2.3市防汛抗旱應急指揮部辦公室主要防汛職責
(1)組織落實市防汛抗旱應急指揮部決定，協調和調動成員單位應對防汛抗旱突發事件相關工作；
(2)承擔市防汛抗旱應急指揮部值守應急工作；
(3)收集、分析工作信息，及時上報重要信息；
(4)負責本市防汛抗旱突發事件風險評估控制、隱患排查整改工作；
(5)負責發布戒備、藍色、黃色預警信息，向市突發事件應急委員會辦公室(以下簡稱市應急辦)提出發布橙色、紅色預警信息的建議；
(6)配合有關部門承擔市防汛抗旱應急指揮部新聞發布工作；
(7)組織擬訂(修訂)與市防汛抗旱應急指揮部職能相關的專項、部門應急預案，指導區縣制定(修訂)區縣防汛抗旱突發事件專項、部門應急預案；