脾主運化，為後天之本，腎主藏精，為先天之本；脾主運化水液，腎主水液。脾腎之間的關係主要表現在先天與後天相互促進及津液代謝方面。
1．先後天關係方面：腎藏精，主人體的生長發育與生殖，為先天之本；脾主運化，為氣血生化之源，為後天之本。先後天之間的關係是“先天生後天，後天養先天”。脾主運化，脾的運化全賴於脾之陽氣的作用，但脾陽須依賴於腎陽的溫煦才能強盛。腎藏精，但腎精必須得到脾運化的水谷精微之氣不斷資生化育，才能充盛不衰，促進人體的生長發育與生殖。
在病理情況下，脾腎之間相互影響。
2．在水液代謝方面
：人體水液代謝是一個複雜的生理過程，是多個臟腑協同作用的結果。其中尤以脾腎的作用更加重要。脾主運化水液，為水液代謝的樞紐，腎主水液，氣化作用貫徹在水液代謝始終，故曰“其本在腎，其制在脾”。概括了脾腎兩髒在水液代謝過程中的作用及其特點。
在病理方面，脾腎兩髒功能失調，如脾腎陽虛等，均可導致水液代謝障礙，出現水腫、泄瀉、小便不利等症。