自2006年9月秋季學期開始，全國高校普遍實行了新的思想政治理論課的課程體系，同時全國統一使用新的教材體系。一切教改問題的關鍵是教員問題。高校思想政治理論課能不能取得好的成績和效果，關鍵在於思想政治理論課任課教師的素質。
教育部副部長李衛紅曾指出：“要認真抓好教師對馬克思主義的真學、真懂、真信、真用問題，真正讓懂馬列、信馬列、有理想信念的教師來教思想政治理論課。”這可以視為是思想政治理論課教師的思想政治素質的標準。一個思想政治理論課任課教師，如果對自己講授的課程缺乏熱情，缺少起碼的業務素養，是不可能講好的。在這一點上，作為受教育者的學生，眼睛是雪亮的。哪個教師真信馬列，講的道理就理直氣壯，就具有說服力、感染力，就受到學生的尊重和歡迎，就會對學生產生巨大的影響。
新的高校思想政治理論課的課程體系和教材體系與“98方案”相比，發生了較大的變化。課程體系的高度整合性對原有教師隊伍的結構提出了新的挑戰；新的教材體系內容的綜合性也對教師的知識結構提出了新的挑戰；大學生新的思想特點對教師更新教育教學方法提出了新的挑戰；經濟全球化和國內市場化的各種趨向，加重了對思想政治理論課必要性的要求。
在這種情況下，帶有根本性的工作是加強思想政治教育及相關學科的建設，加強相關方面的理論研究，不斷提升任課教師的理論水平，具體包括以下四個方面：第一，任課教師應該帶頭掌握馬克思主義基本理論，掌握毛澤東思想、鄧小平理論和“三個代表”重要思想等馬克思主義新成果。要養成注重讀馬克思主義原著的習慣，真正把馬克思主義基本原理弄懂，把馬克思主義與馬克思主義中國化的理論成果聯繫起來，真正做到理論聯繫實際，運用馬克思主義基本原理說明現實社會問題。這是思想政治理論課教師的基本功。
第二，任課教師在教學的學科領域，應該有相應的科研成果。要適應新的教學方案，要在新的形勢下把理論問題講活，教師就必須具有較強的科學研究能力，積累較多的科學研究成果。這樣才能應對日益複雜的思想意識形態領域提出的挑戰，才能在較深的層次上解答學生提出的問題。
第三，任課教師要注重研究青年大學生的各種社會思潮。青年大學生的社會思潮是社會環境的反映，是各種社會矛盾促成的思想意識，是思想政治教育面對的最鮮活的素材，是聯繫大學生思想的最直接的途徑。對社會思潮的研究，應該連續、持久、穩定地進行，堅持數年，就會有明顯的理論水平的提高，就會提高適應當代青年思想實際的能力。
第四，任課教師要深入社會實際，加強調查研究，不斷開闊理論研究的視野。任課教師應該經常深入各個不同領域的社會實際，了解城鄉改革開放、發展社會主義市場經濟的實際情況和遇到的問題，懂得人民大眾的生活疾苦，在社會實際之中不斷尋找新的理論研究的課題。
只要任課教師認識到這一任務的艱巨性和光榮性，不斷改進教學方法，在提高自身理論素養方面矢志不渝，就會使得高校的思想政治理論課的教學水平不斷邁上新的台階。