一、對非正常損失的存貨未作“進項稅額轉出”處理。根據《增值稅暫行條例》第十條規定，非正常損失的購進貨物的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。依照《關於增值稅會計處理的規定》（財政部〔93〕財會字第83號），企業購進的貨物改變用途等原因，其進項稅額，應相應轉入有關科目，借記有關科目，貸記“應交稅金—應交增值稅（進項稅額轉出）”科目。
例如：在資產評估時發現該企業原材料中有屬於非常損失100萬元需要剔除，如該原材料的增值稅稅率為17%，則該項原材料的進項稅額為17萬元（100×17%），在評估調整時，應減少資產原材料100萬元，應增加負債應交稅金17萬元，應減少淨資產（所有者權益，下同）117萬元。如果只減少資產原材料100萬元，減少淨資產100萬元，其評估結果，使基準日的淨資產和負債就不準確。
二、對應付款項中有隱匿收入、平銷返還資金，未作銷項稅額和進項稅額轉出處理。
根據《增值稅暫行條例》第五條規定，納稅人銷售貨物或者應稅勞務，按照銷售額和本條例第二條規定的稅率（17%或13%）計算並向購買方收取的增值稅額，為銷項稅額。
例如：在資產評估時發現該企業應付款項中有隱匿銷售貨物款項117萬元（含稅價）需要剔除，如該貨物的增值稅稅率為17%，則該項銷售貨物款中的銷售額為100萬元［117÷（1＋17%）］，銷項稅額為17萬元（100×17%）。該項銷售貨物款已無銷售成本，在評估調整時，應減少負債應付款項117萬元，應增加負債應交稅金17萬元，應增加淨資產100萬元。如果只減少負債應付款項117萬元，增加淨資產117萬元，其評估結果，使基準日的淨資產和負債就不準確。
根據國稅發［1997］167號《關於平銷行為徵收增值稅問題的通知》第二條規定，自1997年1月1日起，凡增值稅一般納稅人，無論是否有平銷行為，因購買貨物而從銷售方取得的各種形式的返還資金，均應依所購貨物的增值稅稅率計算應沖減的進項稅金。
