國有土地收益是指以出讓、租賃、作價出資等有償方式使用國有土地的單位和個人，按照國家規定的標準和方法，向國家繳納的土地資源性收益，包括土地出讓金、土地租金、土地收益金、新增建設用地有償使用費等。
近年來，隨著土地管理法律法規的健全和深入實施以及“收支兩條線”管理工作的深入開展，國有土地有償使用工作得到突破性進展，土地收益管理明顯加強。但由於多方面的原因，管理中的違規現象時發生。
問題一：管理不規範導致土地收益流失
地方政府違反規定將國有土地無償劃撥給用地單位或開發商，免徵土地出讓金，使國有土地價值無法體現；地方政府減免或緩徵土地出讓金的隨意性較大，特別是在招商引資和企業改組改制過程中，地方政府往往以抄告單的形式減免或緩徵土地出讓金。
問題二：國有土地使用者逃避繳納出讓金
土：地權利人在改變土地用途後，不依法繳納土地出讓金；一些房地產開發商以外商名義規避繳納土地出讓金；一些單位將所屬的空餘劃撥國有上地向社會公開集資建房，每戶收取一定的集資金，實質上成了市場條件下的商品房開發，單位則從中獲取大量的土地收益。
對策一：加強防範，做活土地
首先，全面清理涉及國有土地稅費的各種優惠政策，規範減免程式和範圍，改變以國土收益流失為代價招商引資的做法；其次，充分發揮土地收購儲備中心的職能，設定城市土地發展基金，推行招標拍賣掛牌方式供地，杜絕隱性交易和暗箱操作；再次，停止個人建房審批，規範管理“城中村”建設，要防止城鎮居民“改頭換面”以農村居民的身份申請建房用地；最後，嚴格按計畫供地，堅持“飢餓”供地，實行“淨地”出讓，提升土地價位，改變以地換路、以地抵資的權宜之舉。
對策二：把好“三關”，收支有序
建立健全事前、事中、事後“三位一體”的監督檢查機制，通過定期、不定期的檢查，及時發現存在的問題。把好事前監督關，嚴格其他部門、單位變相批地；把好事中監督關，著力抓好土地稅費會審、資金收繳、收費票據開具幾個環節；把好事後監督關，耐拖欠土地出讓金的，有關部門不得為其發放營業執照、許可證等證件。
對策三：按時繳費，違規必究
對緩徵的土地出讓金，要在規定的時間內繳納完畢，不能一“緩”了之；對拒不繳納土地出讓金的，依法解除土地出讓契約，收回國有土地使用權；對擅自減免的土地出讓金，也要依法追繳；對非法低價出讓國有土地使用權，造成國有土地資產流失的，嚴格依照監察部、國土資源部《關於違反土地管理規定行為行政處分暫行辦法》給予處分，情節嚴重的追究刑事責任。