當前人民民眾反映強烈的另一個問題是“看病難、看病貴。”《決定》對解決這一問題提出了新的辦法和措施。
一是調整醫療衛生資源的配置格局。健全醫療衛生服務體系，重點加強農村三級衛生服務網路和以社區衛生服務為基礎的新型城市衛生服務體系建設，落實經費保障措施。這不僅有利於民眾就近求醫看病，小病不出社區，大病才去醫院；同時，為使民眾能得到高水平的醫療服務，特別提出要實施區域衛生髮展規劃，整合城鄉醫療衛生資源，建立城鄉醫院對口資源、大醫院和社區衛生機構雙向轉診、高中級衛生技術人員定期到基層服務制度，加強農村醫療衛生人才培養。
二是加快完善醫療保障制度。在城市，要在完善城鎮職工基本醫療保險制度的同時，建立健全服務城鎮居民，包括困難職工、下崗失業人員、少年兒童等人群的以大病統籌為主的醫療保險制度。在農村，推進新型農村合作醫療，按照規劃，2006年把試點範圍擴大到全國40%的縣，2007年擴大到60%左右的縣，2008年在全國基本推行，2010年實現新型農村合作醫療制度基本覆蓋農村居民的目標。同時，要加快城鄉社會醫療救助制度的建設，形成多形式的醫療保障體系，提高人民民眾抵禦疾病風險的能力。
三是強化公立醫院公共服務職能，加強醫德醫風建設，規範收支管理，糾正片面創收傾向。關鍵是明確政府責任，增加政府對醫療衛生的投入，對公立醫院實行收支兩條線管理，改變目前公立醫院以藥養醫、片面創收的運行機制。在經濟發展基礎上，要加大政府對疾病預防控制、重大傳染病救治、中醫藥發展和健康教育的投入。
四是建立國家基本藥物制度，整頓藥品生產和流通秩序，保證民眾基本用藥。根據國家、社會、個人承受能力和安全、有效、價廉的原則，建立國家基本藥物制度，保證民眾基本醫療和基本用藥。整頓藥品生產流通秩序，加強藥品價格監管，嚴禁虛高定價。
五是嚴格醫療機構、技術準入和人員執業資格，引導社會資金依法創辦醫療衛生機構，支持有資質人員依法開業，方便民眾就醫。
六是發揮中醫藥和民族醫藥“簡、便、驗、廉”的優勢，大力扶持中醫藥和民族醫藥的發展。