物理常數的測定包括相對密度、鏇光度、折光率、硬度、粘稠度、沸點、凝固點、熔點等的測定。這對揮髮油、油脂類、樹脂類、液體類藥和加工品類藥材的真實性和純度的鑑定，具有特別重要的意義。藥材中如摻有其他物質時，物理常數就會隨之改變，如蜂蜜中摻水就會使比重降低，影響粘稠度。所以《中華人民共和國藥典》 1990年版對有些藥材的物理常數作了規定，如蜂蜜的相對密度在1.349以上，冰片（合成龍腦）的熔點應為205～210℃；肉桂油的折光率應為1.602～1.614等。天竺黃規定檢查體積比，即取竹黃粉末（過 4號篩）10g，輕輕裝入量筒內，其體積不得少於35 ml。這是一種類似測定相對密度的方法，實際上也可推廣用於測定其他藥材，這就比較容易掌握輕重的標準。
膨脹度的測定藥材中含有粘液、果膠、樹脂等成分，有吸水膨脹的性質，如車前子等果實、種子類藥材，種皮含有豐富的粘液質，其吸水膨脹的程度和其所含的粘液成正比關係。按藥典檢查北葶藶子膨脹度不得低於12，遠遠大於南葶藶子膨脹度（不得低於3）。天竺黃，《中華人民共和國藥典》規定檢查其吸水量，也是鑑定天竺黃純度和品質優劣的質量指標之一。
色度檢查含揮髮油類成分的中藥，常易在貯藏過程中氧化、聚合而致變質，經驗鑑別稱為“走油”。藥典規定檢查白朮的色度，就是利用比色鑑定法，檢查有色雜質的限量，也是了解和控制其藥材走油變質的程度。
泡沫指數和溶血指數的測定利用皂素的水溶液振搖後能產生持久性的泡沫和溶解紅細胞的性質，可測定含皂素類成分藥材的泡沫指數或溶血指數作為質量指標。通常如有標準皂素同時進行比較，則更有意義。溶血指數測定時，應說明溫度和套用何種動物的血，以能產生溶血的最低濃度表示之。因所得數據重複性差，所以較少有實用意義。
微 量 升 華是利用中藥中所含的某些化學成分，在一定溫度下能升華的性質，獲得升華物，在顯微鏡下觀察其結晶形狀、顏色及化學反應。如大黃粉末升華物有黃色針狀（低溫時）、片狀和羽狀（高溫時）結晶。
熒 光 分 析利用中藥中所含的某些化學成分，在紫外光或常光下能產生一定顏色螢光的性質進行鑑別。通常可直接取中藥片塊、粉末或浸出物在紫外光下進行螢光分析。如黃連在紫外光燈下，顯金黃色螢光，木質部尤為顯著。秦皮的水浸出液在常光下顯淡藍色螢光。有的藥材如附有地衣或有某些黴菌或黴菌毒素時，也會有螢光現象，應注意區別。一般觀察螢光的紫外光波長為 365 nm，如用短波 254～265 nm時，應加說明，因兩者螢光現象不同。
顯微化學反應是將中藥的乾粉、手切片或浸出液少量，置於載玻片上，滴加某些化學試劑使產生沉澱或結晶，或產生特殊的顏色，在顯微鏡下觀察。亦用於細胞壁和細胞內含物性質的鑑別（見藥典附錄項）。
蛋白電泳法中藥材中含有蛋白質、胺基酸的種類很多，特別是動物藥類和果實種子藥類。以往多用胺基酸測定儀測其種類和含量，但價格貴，難於作定性分析廣泛使用。近年來用聚丙烯醯胺凝膠蛋白電泳法，成功地定性鑑別了大量中藥材。
化學定性分析利用藥材的化學成分能與某些試劑產生特殊的顏色反應或沉澱反應來鑑識。一般在試管中進行，亦有直接在藥材切片或粉末上觀察以了解該成分所存在的部位。如柴胡橫切片，加無水乙醇-濃硫酸等量混合液後則凡是含有皂苷的組織開始呈黃綠色，漸至綠色，最終呈藍色。
化學定量分析定性分析可初步提示有無某種成分，如需要了解其含量多少和是否符合藥用標準，則必需作含量測定。藥典對有些藥材規定要作含量測定，如馬錢子中士的寧鹼的含量不得少於1.2％等。
含揮髮油類、脂肪油類或樹脂、蠟等藥材，除進行其中油、脂、蠟等含量測定外，尚需進行它們的物理常數和化學常數測定，如羥值、酸值、皂化值、碘值等，以表示品質優劣度。《中華人民共和國藥典》尚規定以下幾項常規測定，適用於一般藥材的品質檢查。包括純度檢查、水分、雜質，後者指中藥原植（動）物的非藥用部分、有機雜質和無機雜質。無機雜質的檢查一般採用過篩及灰分、酸不溶性灰分定量等方法來測定；品質優良度檢查包括浸出物、有效成分含量測定。