中藥中雜質的混存，直接影響藥材的純度。這些雜質系指：
① 來源與規定相同，但其性狀或部位與規定不符；
② 來源與規定不同的物質，無機雜質，如砂石、泥塊、塵土等。檢查方法可取規定量的樣品，攤開，用肉眼或放大鏡觀察，將雜質揀出，如其中含有可篩分的雜質，應通過適當的篩籮將雜質篩出。然後將各類雜質分別稱重，計算出占樣品的百分比。如藥材中混存的雜質與正品相似，難以用肉眼鑑別時，套用顯微、理化鑑別試驗，證明其為雜質後，計入雜質重量中。對個體大的藥材，必要時可破開，檢查有無蛀蟲、霉爛或變質情況。雜質檢查所用的樣品量，一般按藥材取樣法稱取。