孔府設有專門管理飲食的機構，有兩個大廚房。廚師技藝高超，他們世代相傳，積累了豐富了烹調經驗。孔府菜烹製精細，注重營養，自成一格。
孔府用於宴席的大菜，有四大件、三大件、二大件的區別。大件菜有：燕菜一品鍋、紅扒熊掌、扒白玉脊翅、御筆猴頭、燒秦皇魚骨、菊花魚翅、神仙鴨子、一卵孵雙鳳、八寶鴨子、繡球魚肚、懷抱鯉、烤花蘭桂魚、乾蒸蓮子、蒸駝足等菜目。
孔府家常菜點有：玉帶蝦仁、松子蝦仁、松子魚糕、七星雞子、鴛鴦雞、一品豆腐、鍋豆腐、炒小豆腐、珍珠湯、什錦素鵝脖、炸溜茄子、油淋白菜、油撥豆莛等，也有經過細制的糊糊、煎餅、鹹菜等山東農家食品。
清光緒二十年(1894)，孔子七十六代孫孔令貽夫婦隨母進京向慈禧太后賀壽，孔母向慈禧送上早膳一桌，這桌早餐的食單內容如下：
海碗菜二品：八仙鴨子、鍋燒鯉魚。
中碗菜四品：清蒸白木耳、葫蘆大吉翅子、壽遼鴨羹、黃燜魚骨。
大碗菜四品：燕窩萬字金銀鴨塊、燕窩壽字紅白鴨絲、燕窩無字三鮮鴨絲、燕窩疆字口蘑肥雞。
懷碗菜四品：熘魚片、燴雞腰、燴蝦仁、雞絲翅子。
碟菜六品：桂花翅子、炒茭白、芽韭炒肉、烹鮮蝦、蜜制金腿、炒黃瓜醬。
片盤二品：掛爐豬、掛爐鴨。
克食二桌。(克食，滿語，意為賞給臣下吃的)。
蒸食四盤，爐食四盤，豬食四盤，羊食四盤。
餑餑四品：壽字油糕、壽字木樨糕、百壽桃、如意卷。燕窩八仙湯、雞絲滷麵。