督查中也發現一些地方部門之間配合得不是很好，案件主辦單位與協辦單位溝通不夠。有的省反映，由於各部門各自行使管理職能，缺少溝通與協調，往往出現多部門對同一行政管理對象多次檢查的情況，生產、經營單位意見很大。此外，農資打假工作多部門操作，部門之間通氣不夠，發文多，部分內容交叉重疊，形式主義的東西也不少，工作實效不高。有的反映泛泛的執法檢查多，實際查處的案件少。農資質量抽檢工作開展不夠，結果公開不夠。多數地方的農資執法，僅僅檢查銷售機構，從銷售機構查出農資產品質量問題時，對銷售者做出處罰後便草草收兵，不再順藤摸瓜，追究更深背景和生產者的責任，使更大違法者逃避了法律制裁，制假售假的源頭未得到有效控制。形成了農資違法案件中，小案多，大案少的假象。
(六)農業行政執法缺乏必要的經費和裝備，執法機構不健全，執法隊伍不穩定
各地普遍反映，缺乏農資打假專項經費，缺少必要的交通、通訊、取證等工具，抽樣檢查、假劣產品的銷毀、聯合執法等系列費用難以解決。參加農資打假的人員大部分是臨時從各系統抽調的，執法意識不強。
基層反映，上級多頭管理，缺乏統一的系統的農業行政執法指導，影響了農業執法的順利進行。
三、農資打假工作的改進意見
(一)從“五不放過”入手，找準農資打假切入點
這次督查組共帶回102個需要督辦的案件，至目前已有85個查處完畢，剩下的17個，還將繼續督辦。有關領導批轉的案件有10起，有9起通過督辦已依法查清並進行了處理，還有1起正在查處中。各地投訴的轉有關業務司局的案件10件，已有1件查清，其餘9件正在追查中。
我們將對這些案件進行分類總結，追根溯源。
在大案要案查處過程中，各級農業執法單位按照有關法律法規進行查處的同時，對於該移送司法機關的案件要及時移送司法機關處理，並與司法機關保持密切聯繫，了解案件的處理結果，還要認真查清偽劣農資源頭和流向。對於源頭非本省、市、縣轄區範圍內偽劣農資，要及時向有關省或市、縣通報情況，請其他省或市、縣查清和處理，或請上級單位處理。
要做到查處的案件有始有終，辦事程式規範，檔案齊全。對領導批示的重大案件，要及時研究處理，做到件件有結果。
(二)建立農資市場監督管理的長效機制
為了適應市場經濟發展的新要求，尤其是我國已加入wto的新形勢，建立農資市場監督管理的長效機制是十分迫切和完全必要的，這也是社會主義市場經濟體制的一個重要組成部分，目前的農資打假方式只能是暫時的應急措施，今後要從機構設定、人員調配、管理機制和經費保證等方考慮這個問題。
在當前農資市場秩序混亂，假冒偽劣農資猖獗的嚴峻形勢下，組織有關部門，建立聯合打假是不可少的。因此，九個部委要繼續加強部門間協作，建立聯合打假的長效機制，進一步認識農資打假的重要意義，在農資打假方面形成合力。在聯合執法檢查過程中，各單位應根據各自的職責在執法過程中各負其責，如技術監督部門主要負責好從源頭打假和從源頭抓質量的工作，工商部門檢查營業執照和市場秩序等，農業部門檢查經營許可證和生產許可證以及產品的包裝標識等。