(五)損害農民民主權利方面。一是村黨組織領導班子成員“兩推一選”和村民委員會直接選舉制度不健全，對村級組織選舉工作的監督不到位，宗族勢力干預和操縱選舉時常發生。隨著基層民眾民主意識的提高，民眾參與選舉的積極性普遍增強，但由於家族意識、幫派意識的存在，在農村的換屆選舉中往往存在著賄選、拉票等現象，此類信訪問題也隨之增多。二是在健全村民會議、村民代表會議和村民議事等制度上沒有落到實處，個人或少數人擅自決定集體重大事項，村民土地流傳、承包，村里修橋鋪路，集體財產拍賣等重大事項，沒有經過村民會議和村民代表會議，而是村支部書記或村委主任個人說了算。三是在村級財務公開上存在名存實亡現象。一些村莊村級財務長期不公開，有的公開一部份，集體收益被村幹部貪污侵占、揮霍一空。很多村幹部是獨斷專行，村民對村務、財務毫不知情。
(六)惠民政策不到位方面。不少村幹部存在貪污、挪用、截留、騙取低保資金、草危房改造款、土地直補款、社保基金等行為。如某縣李莊村在草危房改造、水稻直補、五保戶供養等方面均存在截留、剋扣的現象。有的村幹部在發放土地補償費上對“釘子戶”進行照顧，從而造成民眾心裡不平衡，多次進行越級訪和非正常上訪。
(七)基層政府機關政務不公開透明方面。在土地開發使用上沒有及時公示，也沒有做好宣傳工作，讓民眾產生誤解，使民眾覺得政府侵占了民眾的利益，導致矛盾激化，便轉而通過非正常渠道長期上訪。
二、信訪問題產生的根源
(一)從客觀上看，信訪問題是經濟社會發展到一定時期的歷史產物。一是隨著經濟利益關係的調整，人民民眾比以往任何時候更加關注和注意維護自身的經濟利益，信訪問題大多是利益之爭;二是民眾的民主意識、法制意識、政策觀念普遍增強，而部分基層幹部素質相對較低，不能適應工作需求;三是由於一些政策不配套，基層在執行過程中難以適從;四是信訪工作力量比較分散，資源配置不科學，使信訪工作難以整合力量，統一行動，使信訪工作帶有明顯的“人治”現象。
(二)從主觀上看，主要包括基層幹部和上訪民眾兩方面的問題。基層幹部方面主要存在四個方面的問題：一是幹部思想認識不高、重視程度不夠。有些幹部重發展、輕穩定，對信訪工作的重要性認識不足，沿襲著“救火式”、“應急式”的工作方式，對待老上訪戶的問題,不是想辦法去處理遺留問題,而是採取極端的“穩控措施”，或是花錢買平安，沒有真正起到第一道防線的作用;個別基層幹部不體會上訪民眾的心態，聽到有民眾上訪，不是主動接觸，而是怕麻煩，繞道走，不搭理，致使本來只需幾句勸慰話就可解決的問題，卻激化成矛盾，釀成群體性事件或大規模越級上訪;有的不按照政策辦事，方法簡單、作風粗暴，甚至與民爭利，不僅不能及時化解矛盾和糾紛，反而導致問題積累，矛盾激化。二是基層幹部觀念落後、方法不當。一些地方和部門科學民主決策機制不健全、不完善，民主氛圍不濃，出台政策措施的連續性和平衡性不夠;一些基層幹部素質偏低，分析問題、解決問題的能力較差，被動服務，管理滯後;有些基層幹部民眾觀念淡漠，不重視初信初訪工作，引發越級上訪和重複上訪;有的幹部對民眾越級上訪採取簡單地“攔、堵、卡、截”，沒有真正把功夫下在解決問題上，導致重複越級上訪現象越來越多，個別基層單位每年用在去省進京接訪和“穩控”上訪人的費用超出處理本身信訪問題的幾倍，甚至幾十倍;一些工作人員缺乏接待藝術，不依法行政，使上訪人心理上受到刺激或得不到滿意答覆而長期上訪。三是基層幹部作風不正，以權謀私。少數鄉鎮幹部在處理農村信訪問題時，袒護村幹部，遲遲不作處理，造成民眾長期上訪。個別基層幹部在執行政策上大搞利己主義，凡是自己能沾得上邊的，就想盡辦法實施兌現，自己或親屬沾不上利益的，則以村民自治、民眾集體意見來推推擋擋;少數人受利益驅動，為了達到自己的目的，千方百計製造事端，組織策劃民眾上訪，煽動民眾鬧事，以便自己從中獲利。四是基層幹部責任心不強、敷衍了事。一些幹部對查出的問題沒有引起足夠重視，去採取有效措施予以認真解決，而是以種種藉口大事化小，小事化了。有的基層幹部對民眾的上訪採取壓制或報復的方式對待，導致小問題拖成大問題，初訪逐步演變成重複訪。