——堅持審計與專項審計調查並重，每年開展的專項審計調查項目占整個項目的一半左右。重點調查國家政策法規執行中存在的問題和重大決策的落實情況，關注財政資金使用效益和涉及民眾切身利益的突出問題，促進國家相關政策制度的落實和完善。
五、繼續著力加強三項基礎工作：
——實行科學的審計管理，不斷創新審計管理方式和方法，整合審計資源，促進提高審計工作層次和水平。
——著力完善審計質量控制體系，進一步規範審計行為，防範審計風險。
——進一步探索和完善信息化環境下新的審計方式，大力開展計算機審計，積極推廣先進的審計技術方法，促進提高審計工作效率和質量。
六、財政審計，以促進規範預算管理，提高財政資金使用效益，建立社會主義公共財政制度為目標，以中央預算執行審計為重點，以支出審計為主，實行中央本級支出審計與轉移支付審計並重，全面提升預算執行審計的層次和水平。注重整體性，對預算執行的總體情況作出評價；注重效益性，檢查財政資金使用效益；注重巨觀性，對一些涉及巨觀政策的問題提出審計意見；注重建設性，對關係財政經濟發展的重要問題提出建設性意見。
——進一步加強中央本級支出審計，促進建立科學的預算定額和支出標準，規範預算管理。
——深化中央一級預算單位審計，加強對與一級預算關係密切的重點二、三級單位的審計監控，注意從總體上把握和分析部門單位的預算執行情況，促進加強和改進管理，揭露預算執行中的突出問題，使一級單位預算管理基本達到規範，二、三級單位違法違規問題明顯下降。
——適應預算管理體制改革的需要，探索部門決算(草案)審簽制度。
——以促進建立科學規範的財政轉移支付制度為目標，強化中央轉移支付審計。統籌安排各專業審計力量，採取審計與專項審計調查相結合的方式，逐步擴大轉移支付資金審計監督覆蓋面，重點檢查涉及執行國家巨觀政策的轉移支付資金管理使用情況，促進規範管理，提高資金使用效果。同時注意從完善轉移支付體制、機制方面研究和揭示問題。
——固定資產投資審計以效益審計為主，加強對關係國計民生的國家重點投資項目的審計，促進加強項目管理，提高投資效益，深化投融資體制改革。
——組織開展對國家重點建設資金管理、分配和使用效果的審計和專項審計調查，促進科學決策、規範管理。
——積極開展資源與環境審計，加強與資源開發和環境保護有關的資金、重點生態保護工程、重點流域(或區域)污染治理項目的審計和審計調查，探索符合我國國情的制，全面提高審計隊伍素質。
——加強領導班子建設。按照提高素質、最佳化結構、控制規模、增強能力的要求，科學合理地配置領導班子，不斷提高領導班子的凝聚力和戰鬥力。
——繼續堅持以競爭上崗和雙向交流為主要內容的幹部選拔和任用機制，完善審計系統幹部選拔和任用制度，不斷提高幹部隊伍素質和水平。
——按照公務員分類管理要求，繼續探索審計人員職業化管理體制，健全科學的業績考評體系，逐步形成幹部能上能下的機制。