財務會計工作是衛生院經濟管理工作的重要組成部分，在衛生院經濟管理工作中處於核心地位，發揮著不可替代的重要作用。衛生院的領導者尤其是院長應當重視財務會計人員，促使其始終緊緊圍繞會計工作責任目標，依法實施會計核算和會計監督，切實為單位的經濟發展提供最大限度的財務會計支持，確保衛生院經濟健康有序運行。
一、嚴格執行會計法律、法規、規章和國家統一會計制度的規定，依法開展各項會計工作。
（一）規範會計行為
衛生院會計人員應始終遵守衛生系統幹部職工管理規定，規範自身行為，擁護黨的領導，貫徹“三個代表”重要思想，在科學發展觀的指引下，以改革的精神加強和審視自己，遵紀守法，愛崗敬業，不參與印製、散發、買賣、傳閱“lhc”及其它形式的黃賭毒、邪教等活動。
（二）遵守會計職業道德
衛生院會計人員應自覺遵守會計職業道德，樹立了良好的職業道德品質和嚴禁的工作作風，嚴守工作紀律，熱愛本職工作，努力鑽研業務，按照財經紀律及會計法律、法規、規章和國家統一會計制度規定的程式和要求進行會計工作，保證會計信息的合理、合法、真實、準確、及時和完整，保證會計事項實事求是、客觀公正，努力熟悉單位業務管理情況，運用掌握的會計信息和會計方法，為改善單位的內部管理和提高經濟效益服務，切實保守單位秘密。
（三）履行會計職能
《中華人民共和國會計法》第五條規定：“會計機構、會計人員依照本法規定進行會計核算，實行會計監督。”核算和監督是會計的法定職能。
首先，從履行會計核算職能來看，衛生院會計人員應當熟練掌握相關會計業務，規範會計核算，正確分攤醫療服務成本和藥品成本，如實反映收支及財務狀況，適時為衛生院經濟管理提供可靠的決策依據。主要表現在以下幾個方面：
1、填制會計憑證
嚴格根據會計核算的規定和要求，保證會計憑證的設定、取得、登記、核對、傳遞、結帳等符合國家統一會計制度的規定，做到了內容真實、方法正確、數字準確、字跡工整、摘要清楚、簽章齊全、帳證相符、裝訂整齊。
2、登記會計帳簿
嚴格根據會計法律、法規和國家統一會計制度的規定，結合單位實際，正確設定了總帳、明細帳（包括收支明細帳、藥品明細帳、往來明細帳、基金明細帳、固定資產明細帳等）、日記帳（包括銀行存款日記帳、現金日記帳）和其它輔助帳等，保證了會計帳簿的啟用、登記、核對、結帳、更正方法等符合國家統一會計制度的規定，做到了記帳及時、關係對應、帳目清楚、數字準確、帳帳相符。
3、編制財務報告
嚴格按照國家統一會計制度的規定，定期編制財務報告（包括財務報表及其說明），做到了種類完整、格式統一、項目齊全、內容工整、數字真實、計算準確、審核無誤、印章齊全、說明清楚、封面規範、報送及時。
其次，從履行計監督職能來看，會計人員應當堅持原則，按照相關要求建立健全了單位內部會計監督制度，依法對本單位經濟活動進行監督。主要是：
對原始憑證的完整性、真實性、合法性進行監督；
對偽造、變造、故意毀滅和帳外設帳的行為進行監督；
對實物、款項、編造和篡改財務報告的行為進行監督；
對違反國家財經紀律、財務制度、會計制度、國家利益和社會公眾利益的財務收支進行監督；
對違反單位制定的財務計畫、經濟計畫、業務計畫等的財務收支進行監督。
在監督過程中，嚴肅財經紀律，執行會計法律、法規和國家統一會計制度及衛生系統有關財務會計方面的各項規定，落實單位內部各項財務管理措施，對已發現的不符合規定的情況，按照職權依法予以了制止和糾正，制止和糾正無效的，能夠及時向單位負責人報告，請求處理。
（四）強化單位內部會計管理
衛生院作為獨立核算的經濟實體，應當按照上級主管部門的要求，根據會計法律、法規、規章和國家統一會計制度的規定，結合單位實際，建立財務管理制度和內部會計管理制度，強化財務管理，確立單位內部會計管理體系和會計基礎，明確單位負責人對會計工作的領導職責，建立會計人員崗位責任制，依法確定會計和出納的職責和許可權，全面規範了各項會計基礎工作，嚴格了會計業務操作程式，切實體現單位業務管理特點和要求，保證會計工作的有序進行。
（五）按時按質按量完成上級主管部門安排的各項任務，搞好其他相關工作
1、按照上級主管部門的要求，在年初及時編制單位收支及工資預算，根據相關規定，落實各項措施，按規定計提各種基金，結合實際及時計算、分配和發放職工工資，及時辦理了職工正常晉級增資業務，年度終了，按要求及時結帳搞好會計決算工作。
2、根據衛生部《醫療機構藥事管理暫行規定》和相關要求，建立了衛生院藥事管理制度，加強了對藥品採購、驗收、儲存、保管、銷售等的監督與管理，杜絕私自採購行為，按規定正確辦理款項結算。
3、及時清理往來款，做到應收盡收，應繳盡繳，嚴格杜絕呆帳、爛帳和死帳。
4、按照物價部門制定的醫療服務基準價格，制定了衛生院常規醫療服務收費規範，明碼示價，規範了收費行為，加強了發票管理，對門診及住院收費及時清理，盡力避免拖欠，禁止挪用；堅持“勤儉辦事業，制止奢侈浪費“的方針，加強公用經費支出和醫療服務成本管理，努力提高資金使用效益。
5、定期和不定期與開戶銀行及出納對帳，保證單位銀行存款及庫存現金帳實相符。
6、加強實物資產管理，切實搞好固定資產和藥品的清理盤點工作。
7、對本單位醫生及村醫進行財務培訓，強化鄉村一體化財務統一管理。