，以及分倉保管賬、保管總賬、統計報表、會計報表、輔助賬表、原始憑證等賬務資料，契約、運單、發票等反映糧食出入庫業務的憑證，糧食測溫、測濕、熏蒸等作業記錄，為後續普查、複查、抽查做好準備。
（三）普查階段
4月20日前，由市級人民政府按綜合交叉的原則組織對本行政區域內糧食庫存情況進行全面普查，確保不留死角。普查範圍應嚴格與省分解下達的分庫點糧食庫存統計資料的口徑一致。重點非國有糧食經營企業及轉化用糧企業執行糧食流通統計制度情況檢查及糧食庫存典型調查，結合各市普查工作一併開展。典型調查可選擇在當地市場具有一定代表性的3～5家庫存規模較大的企業。普查期間要保留完整的工作底稿、原始記錄等資料。
（四）複查階段
4月底前，省級領導小組辦公室抽調業務骨幹，組成若干個清倉查庫複查工作組，由省級領導小組成員帶隊，每組負責1—2個市，對所到市的重點地區、重點企業和重點環節進行複查，對該市的普查工作作出評估。複查比例為該市納入檢查範圍糧食庫存總量的20%～30%，對複查企業個數不作規定，但要照顧到中央儲備糧、國家臨時存儲糧和地方儲備糧複查數量的大致均衡。複查的同時進行質量抽檢，抽樣代表數量為被複查企業所承儲中央儲備糧、國家臨時存儲糧和地方儲備糧庫存量的25%左右，所抽取的樣品實行跨省交叉檢驗。複查工作結束後，各複查工作組將複查期間形成的工作底稿、原始記錄等資料，連同複查工作總結報告及相關匯總表，一併提交省級領導小組辦公室。總結報告及相關匯總表需經組長簽字。
（五）抽查階段
5月10日開始，國務院抽查工作組對我省糧食庫存情況採取不事先打招呼、隨機選點的方式進行抽查，抽查的企業不少於10個。質量抽查的抽樣代表數量為被抽查企業所承儲中央儲備糧、國家臨時存儲糧和地方儲備糧庫存量的25%左右，抽查樣品實行集中統一檢驗。各市、縣要做好迎接國家抽查的各項準備工作。
（六）檢查結果匯總上報和整改階段
各地要在全面檢查糧食庫存的基礎上，對清倉查庫工作進行認真總結，逐級匯總檢查結果，編制相關報表和檢查工作報告。各級糧食清倉查庫工作領導小組要對庫存檢查結果層層把關，數據匯總中發現有錯統、漏統、重複統計、虛報庫存數量等問題，要及時糾正，對檢查認定的賬實差數要做出詳細的書面說明。對檢查中發現的問題，要在認真核實的基礎上提出整改措施，由主管部門下發整改通知書，並督促企業限時報送整改結果，有關資料存檔備案，並在檢查報告中如實反映，視問題成因和嚴重程度進行問責。
5月10日前，各市人民政府向省級領導小組辦公室提交清倉查庫工作總結報告及相關匯總報表。總結報告包括縣級組織企業自查和市級組織普查情況、重點非國有糧食經營企業及轉化用糧企業執行糧食流通統計制度情況檢查及糧食庫存典型調查等情況。
5月底前，市、縣級領導小組辦公室應辦理完畢所接收的與糧食庫存數量和質量相關的舉報案件，並向上一級領導小組辦公室提交核查報告。
5月30日前，省人民政府向部際聯席會議辦公室提交清倉查庫工作總結報告及相關匯總報表。省級總結報告包括市級普查工作匯總情況和省級複查工作情況。6月15日前，省級領導小組辦公室辦理完畢所接收的與糧食庫存數量和質量相關的舉報案件，並向部際聯席會議辦公室提交核查報告。