《新元史》卷二百十六·列傳第一百十二

明年七月，勃羅帖木兒入中書丞相，除祖仁山北道肅政廉訪使，召拜國子祭酒。遷樞密副使，累疏言軍事利害，不報，辭職。除翰林學士，復拜中書參知政事。是時，天下大亂，祖仁性剛直，與時宰議論數不合，乃超授其階榮祿大夫，而仍還翰林，為學士。尋遷太常禮儀院使。

二十七年，明兵已取山東，朝廷方疑護廓帖木兒有不臣之心，置撫軍院總兵馬以備之。祖仁與翰林學士承旨王時、待制黃哻、編修黃肅上書曰：

近者，南國不逾月而逼畿甸，朝廷雖合也速出師，然勢力孤危，不足為京題禁止，宗社安危正在今日。

臣愚以為，馭天下之勢，當論其輕重、強弱，遠近，先後，不宜膠於一偏，狃於故轍。前日南軍尚遠，擴廓帖木兒近在肘腋，意將覬覦非分，不得不亟於致討。今擴郭帖木兒勢已窮蹙，而南軍長驅北犯，山東瓦解。是擴廓帖木兒弱而輕，南軍強而重也。陛下與皇太子，宜審其輕重、強弱，改統更張。撫軍院諸臣，亦宜以公天下為心，審時制宜。擴廓帖木兒既不能復振，分撥一軍足以擒獲。其餘見調一應軍馬，宜令其倍道東行，勤王赴難，與也速等聲勢聯絡，仍遣重臣分道宣諭督催，庶幾有濟。如復膠於成見，動以言者為擴廓帖木兒遊說，而鉗天下之口，不幸猝有意外之變，則天下之事去矣。

書上，不報。

十二月，祖仁又上書皇太子言：

近降詔削河南兵馬之權，雖所當然，然此項軍馬終為南軍所畏，即使有悖逆之心，朝廷以忠臣待之，其心愧沮，亦何所施。今未有所見，遽以此名加之，彼若甘心，以就此名，其害有不可言者。朝廷苟善用之，豈無所助。然人皆知之，而不敢言者，誠恐誣以受賄，謂為之遊說也。況聞擴廓帖木兒屢上書，疏明其心跡，是其心末絕於朝廷，以待朝廷之昭灑。今為朝廷計者，不過戰、守、遷三事。以言乎戰，則資其觭角之勢；以言乎守，則待其勤王之師；以言乎遷，則假其藩衛之力，勉強策勵，猶恐遲晚。豈可使數萬之師，棄置於無用之地？今宗社存亡，只在旦夕，不幸有唐率宗倉卒之事，是以祖宗之社稷人民委而棄之。臣雖碎首粉身，亦無濟於事矣！

疏上，亦不報。

二十八年秋，明兵至近郊，詔祖仁及同僉太常禮義事王遜志等，奉太廟神主，從皇太子北行。祖仁等奏曰：“天子有大事，出則載主以行，從皇太子，非禮也。”帝然之，命祖仁守太廟以俟。未幾，帝北奔，祖仁不果從。京城陷，將出健德門，為亂軍所殺，時年五十五。

史臣曰：“元季國勢阽危，所恃以御賊者，惟擴郭帖木兒一人，而李士贍猶嫌其兵權太重。擴廓帖木兒劾張思道等不聽節制，士贍又持其事不下。當時執政大臣，士贍號為通達時務者，乃暗於機權如此，其亡國不亦宜乎！張楨、陳祖仁屢進讜言，終無尺寸之效。祖仁請昭洗擴廓帖木兒，其言尤激切，惠宗父子屏而不用，惜哉？”