根據稅務爭議內容的不同及當事人的作為和不作為，《中華人民共和國稅收徵收管理法》規定了不同的處理程式：
（1）必須複議的程式。即對於納稅的爭議，當事人必須先經過徵稅機關的上一級稅務機關的行政複議，然後才能進入訴訟程式。在這裡，申請複議必須滿足兩個條件：一是要以當事人的名義提出；二是要依法繳納或者解繳稅款及滯納金。其實，本條規定里隱含著另一個條件，即必須要按行政複議法的規定，在法定期限內提出。符合這些條件的複議申請，有複議管轄權的稅務機關必須受理並應在法定期間作出複議決定。申請人如果對複議決定不服的，可以在法定期間向法院起訴；
（2）選擇複議的程式。即當事人對稅務機關的處罰決定、強制執行措施或者稅收保全措施不服的爭議，既可以在法定期間向有複議管轄權的稅務機關申請複議，不服複議決定再訴諸法院；也可以在法定期間直接訴諸法院。但是，當事人不能在同一時間內既申請複議又提起訴訟，而只能選擇一個途徑。以上兩項程式適用於處理稅務爭議當事人的作為；
（3）當事人對處罰決定不作為的處理程式。即當事人對處罰決定不申請複議，不訴諸法院，也不予履行。這是一種特殊的行為方式，其後果致使稅務機關既不能行使權力，也無法承擔責任。
由於原來法律沒有規定強制執行措施可以適用於處罰規定，稅務機關面對當事人的不作為，便無計可施，也正因為當事人的不作為，稅務機關的處罰決定究竟有無過錯？
是否應承擔何種責任？也無法判明。對此，現行法律賦予稅務機關既可以申請人民法院強制執行的權利，以確保國家稅務行政管理的有效實施，也可以由稅務機關依照本法第三十六條的規定強制執行，從而可以對當事人的不作為行為及時作出處理。