一、鑑別試驗
鑑別就是利用化學法、物理法及生物學方法來確證生化藥物的真偽。通常，需用標準品或對照品在同一條件下進行對照試驗。現將常用的鑑別方法簡述如下。
1.化學反應法 通常利用藥物與某試劑在一定條件下反應，生成有顏色的產物或沉澱進行鑑別。例如，溶菌酶的鑑別採用呈色法：溶菌酶分子中的四個肽鍵上的氮原子能與銅離子（cu2＋）絡合，生成有顏色的絡合物，肽鍵越多，產生的顏色越深。胃蛋白酶的鑑別採用沉澱法：胃蛋白酶是具有高效、專一催化活性的特殊蛋白質，易受酸、鹼、重金屬或有機溶劑等的作用，破壞蛋白質肽鏈的空間結構，引起蛋白質變性，生成不溶性的沉澱。
2.紫外分光光度法 三磷酸腺苷二鈉的分子中具有共軛系統，能吸收紫外光。本品的0.01mol／l鹽酸水溶液（20μg／ml），在（257±1）nm的波長處有最大吸收。a250nm／a260nm的值應為0.17～0.27。
3．酶法 尿激酶是專屬性較強的蛋白水解酶，根據尿激酶能激活牛纖維蛋白溶酶原，而具有相同作用的鏈激酶不能激活牛纖維蛋白溶酶原而加以區別，並用直接觀察溶解纖維蛋白作用的氣泡上升法作為判斷指標。
4.電泳法 肝素的鑑別採用糖凝膠電泳法：肝素是由d-硫酸氨基葡萄糖和葡萄糖醛酸分子間組成的酸性粘多糖，其水溶液帶強負電荷，於瓊脂凝膠板上，在電場作用下，向正極方向移動，與肝素國家標準品對照，其移動位置應相應，
5. 生物法利用生物體進行試驗來鑑別藥物。例如，用家兔驚厥試驗來鑑別胰島素，是通過胰島素的降血糖作用進行鑑別的，當劑量過大，血糖降低至一定水平（約30％），家兔即發生驚厥，迅速靜注50％葡萄糖注射液，補充血糖，驚厥停止，說明驚厥是胰島素所致低血糖而引起的。又如，根據肝素鈣具有延長血凝時間的特性進行鑑別。
應該指出，由於生化藥物的結構複雜，仍有一部分生化藥物目前還未找到有效的鑑別方法。例如糜蛋白酶、糜胰蛋白酶、胰蛋白酶等。
二、雜質檢查 生化藥物分子較大，結構複雜，有時成分並非單一，純化工藝較難，因此，生化藥物的雜質檢查就顯得非常重要。
1．一般雜質檢查 生化藥物的一般雜質檢查項目包括氯化物、硫酸鹽、磷酸鹽、銨鹽、鐵鹽、重金屬、酸度、溶液的澄清度或溶液的顏色、水分及乾燥失重、熾灼殘渣等。其檢查的原理及方法與化學藥物中的一般雜質檢查相同，不再贅述。
2．特殊雜質檢查特殊雜質主要是指從生產工藝中引入或原料中帶入的雜質。許多生化藥物是從生物組織中提取或用微生物發酵法製得，藥物中易殘存一些雜質或其他成分。例如，胰蛋白酶是從動物膜中提取製得的一種蛋白水解酶，在製備過程中．易帶入雜質糜蛋白酶，中國藥典（1995年版）和usp（23）均規定要檢查此酶，根據胰蛋白酶的特性選用n-乙醯-l-酪氨酸乙酯為底物作糜蛋白酶的限度檢查。糜蛋白酶的限度為2500個胰蛋白酶單位中不得大於50單位，按每1mg胰蛋白酶為 2500個單位和每1mg糜蛋白酶為1000單位，折算成重量，則糜蛋白酶的限度為5％（g／g）。
三、安全性檢查
1.熱原檢查法（家兔法） 本法是將一定劑量的供試品，靜脈注入家兔體內，以其體溫升高的程度，判定該供試品中所含熱原是否符合規定，是一種限度試驗法。
（1）檢查法：取適用的家兔3隻，測定其正常體溫後15min以內，自耳靜脈緩緩注入規定劑量並溫熱至約38℃的供試品溶液，然後每隔1h按前法測量其體溫1次，共測3次，從3次體溫中最高的一次減去正常體溫，即為該兔體溫的升高度數。如3隻家兔中有1隻體溫升高0.6℃或以上，或3隻家兔體溫升高均低於 0.6℃，但升高的總數達1.4℃或1.4℃以上，應另取5隻家兔複試，檢查方法同上。
（2）結果判斷：在初試3隻家兔中，體溫升高均低於0.6℃，並且3隻家兔體溫升高總數低於1.4℃；或在複試的5隻家兔中，體溫升高0.6℃或0.6℃ 以上的家兔數僅有1隻，並且初試、複試合併8隻家兔的體溫升高總數為3.5℃或3.5℃以下，均認為供試品的熱原檢查符合規定。