不同的種類和藥用部分，採收時間也不同。
①昆蟲類必須掌握季節，因蟲的孵化發育皆有定時。桑螵蛸應在三月中旬前採收，過時卵鞘就已孵化；以成蟲入藥的，均應在活動期捕捉，如土鱉蟲等；有翅昆蟲，在清晨露水未乾時捕捉，因此時不易起飛，如紅娘子、青娘子、斑蝥等。
②兩棲類夏秋兩季捕捉，如蘄蛇、烏梢蛇、金錢白花蛇、蟾酥等；白露前後捕捉，如黑龍江林蛙等。
③脊椎動物大多數均可全年採收，如龜甲、雞內金、夜明砂、五靈脂、穿山甲等。
④生理、病理產物捕捉後或在屠宰場採收，如熊膽、牛黃、馬寶、猴棗等；但鹿茸需在清明後45～60天（5月中旬至7月下旬）鋸取，過時則骨化。鹿角多在春季拾取。