7、投資資金總額不對，多出的投資額去向不明。收購原hk公司時，通過浙江dy*建bh公司先後匯入hk公司賬戶兩筆投資共××萬元以收購hk公司，原公司所有者直接將款項提走。由於財務上沒有將該經濟事項入賬處理，為使hk公司賬面實收資本達到××萬元，***集團又投入資金××萬元，這樣***集團前後共投入hk的投資資金實際為××萬元，而hk公司賬面僅顯示收到投資款××萬元，其中20萬元從hk公司賬面上未得到體現。
另：原收購hk公司的××萬元中，實際包括收購hk大藥房的××萬元，但由於財務上一直沒有作相關的賬務處理，導致至今hk大藥房的賬面實收資本為 0，hk公司賬面的投資也為0的現象。hk大藥房的報表一直沒有與hk公司的報表進行合併，集團財務也未作要求。導致hk公司的員工至今仍認為集團對hk 大藥房未作投資。
8、倉庫盤點方式不正確。在近一年的時間裡，每月三次的庫存檔點，均不知道應該在盤點前根據庫存商品賬面數預先準備好盤點清冊，並與業務處內勤、倉庫保管員對賬後再進行盤點。現場盤點時，僅用空白紙張記錄實物數，盤點完畢後，再回公司核對賬務，白紙上記錄的盤點數又不敢保證數字
準確，還要多方核對。根本無法現場發現是否存在賬實不符的情況。庫存檔點流於形式。
9、財務無法對業務提成及開發票申請進行有效審核。物流會計由於沒有《發貨收款台賬》，電腦賬又跟不上業務進度且無法保證準確，因而無法對《發票開票申請表》及《業務提成表》進行審核。目前實際操作方法是：由出納借用業務處保存的《發貨申請表》，經查找核對後進行審核。不僅大大增加出納的工作量，且不能保證其準確性，也造成對開票和業務提成審批的拖延，降低財務服務質量。對此經營公司領導及業務員多有怨詞。
10、物流賬務處理缺乏基本技能。調貨、換貨沒有按規定的程式進行處理，物流會計也不明白應該如何處理，從而導致電腦賬因物流不規範而無法處理，電腦中數據明顯不可用。
11、財務對物流失控。除北生產品外，批發部經營的其他代理藥品在財務處、業務處均沒有台賬(只是在倉庫設一核算員進行核算，且登賬不及時)，難以進行有效的監督和控制。
12、財務對大藥房失控。大藥房的進、銷、存賬均由櫃檯營業員自己登記，財務處只由費用會計登記金額賬，沒有登記相關的商品品種明細和數量，因而無法對該業務進行有效的監督和控制。
二)、物流程式方面存在的問題：
1、入庫不規範。業務處將股份公司寄到的發貨回執交倉庫保管員，收到貨物後，不經質檢檢驗簽字，由倉庫員直接入庫，填開入庫單。入庫單無質檢聯。而目前集團公司要求的規範作法是：經營公司業務處接到貨物後清點與訂購單及供貨單位的發貨回執無誤後，立即填開入庫單，質量部門驗收合格簽字後，倉庫保管員根據入庫單驗貨無誤入庫後簽字，分別交至業務處及財務處記賬(入庫單上須註明生產批號)。
2、出庫不規範。
發貨程式不規範，是造成整個hk公司物流賬務混亂的根源。
按上次審計現場整改的要求，hk公司發貨程式是：將審批完的發貨申請表傳真給庫管員發貨 → 登記發貨通知單 → 登記銷售台賬 → 登記產品發貨明細賬。而目前集團公司要求的規範作法是：行銷公司業務處接到已批准的“發貨申請表”立即填開出庫單(出庫單上要填寫“發貨申請表”編號及生產批號)→ 質量部門簽字後 → 倉庫保管員憑出庫單“發貨聯”發貨 → 業務處組織發運。出庫單“業務聯”交業務處內勤記賬，“財務聯”交財務處記賬。
上一次審計現場整改中：不要求業務處開據出庫單;倉庫保管員根據傳真來的發貨申請表進行發貨最後補開出庫單;各部門根據發貨申請表登記相關台賬。