祁連山的平均山脈海拔在4000米～5000米之間，高山積雪形成的碩長而寬闊的冰川地貌奇麗壯觀。海拔高度在4000米以上的地方，稱為雪線，一般而言，冰天雪地，萬物絕跡。然而，祁連山的雪線之上，常常會出現逆反的生物奇觀。在淺雪的山層之中，有名為雪山草甸植物的蘑菇狀蠶綴，還有珍貴的藥材——高山雪蓮，以及一種生長在風蝕的岩石下的雪山草。因此，雪蓮、蠶綴、雪山草又合稱為祁連山雪線上的“歲寒三友”。
祁連山的四季從來不甚分明，春不象春，夏不象夏。所謂“祁連六月雪”，就是祁連山氣候和自然景觀的寫照。
祁連山的原始森林景區更是風光迷人，立夏之後，山林之中一片一望無際的綠色海洋。祁連山的原始森林區內，有15.7萬公頃，200多萬立方米的森林資源。是青海省較大的林區之一。這 里有雲杉、圓柏、楊樹等林木以及鞭麻、黑刺、山柳等灌木。此外，祁連山的密林雪嶺之中，還有許多遊蕩的鹿群或奔跑，或徘徊其間，野趣濃烈，生態優美。
祁連山中的河谷和窪地，海拔平均3000多米；而祁連山浪峰般的高山頂則在4000至5000米之上。一路之上履冰踏雪，寒風刺骨。但有著使你目不暇接，可盡情觀賞的大自然之美。祁連山的每一個山峰本來就顯得氣勢雄偉，人稱是“石骨崢嶸，鳥道盤錯”。這些由冰雪和石頭凝成的奇形怪狀、稜角分明的脈脊，有如用巨斧劈雕一般。至於因高山上終年積雪而形成寬闊碩長的冰川，那是雪山的一絕！冰川是長年不溶化的，好似披掛在雪山眾神身上的條條潔白的“哈達”。它們千姿百態，躺臥在雪山上，如白虎藏匿，如銀蛇盤繞；在正午陽光的照射下，有如鑽石發出萬簇光芒；在霞光的色染中 ，冰川則有無法描摹的瑰麗！
祁連山中多河，這是因為在著終年覆蓋的雪山，數不盡的冰川；每當暖季來到，陽光總會融化掉上面的一層冰雪；再加上森林帶的降雨，水源之沛，無疑是眾河不盡之源。
河谷窪地一帶，成片的是野生的柳樹、楊樹，還有叢叢簇簇的刺槐。只是它們均顯得古老、蒼勁而又扭曲，古老得使你無法估算它們的年輪。從它們中間粼粼流著的八寶河，氣質極不諧調。不過這並不傷八寶河的大雅。