第二，中國小公用經費嚴重不足。XX年我市中國小公用經費實際支出3884萬元，國小生平150元，國中生平300元(省鄂財教發[XX]50號檔案規定公用經費標準為國小140元/人、年，國中360元/人、年)。實行“一費制”後，國小每生每年只能收80元，缺口70元;國中每生每年只能收160元，缺口140元，全市國小公用經費缺口980萬元，國中公用經費缺口832萬元，合計缺口1812萬元，而市級財政沒有預算公用經費。如我市的一所中心國小，XX年秋季在校學生1100人，總收入(80元×1100人)為88000元，減去課本費55000元，練習本5500元，淨收入只有27500元，學生人平公用經費只有25元。而本學期公用經費支出需要56000元，(其中教師用書XX元，水、電費9000元、辦公費16000元，還有郵電費、維修費、教學設備添置費、占用費等)缺口XX0多元。由於債務未化解，有的中國小欠銀行債務，開學後所收雜費銀行只給學校留下書本費，其餘全部扣抵債務，導致正常教學秩序難以維持，辦公設備、儀器用具無錢購置，水電費無法支付，有的學校住讀學生自習、教師辦公，晚上點蠟燭。民眾埋怨學校，教師也不能安心教學，出現了新的“讀書無用論”，每年都有學生虛報年齡外出打工賺錢的輟學現象。
第三、“非一費制”學校沒有收費政策。我市有39所學校實行“非一費制”。“非一費制”意即能收取一定的費用，所以在財政預算安排上比“一費制”學校年人平少安排近3300元左右，而市政府又沒有明文規定學校收費標準、收費項目，學校也不敢亂收，造成“非一費制”學校教師供給水平更低，公用經費不足，學校處於進退兩難的地步，只有翹首以盼政府能儘快出台新的政策。
第四，農村稅費改革，使民辦教師的問題突出。稅費改革後，為了減輕學校壓力和財政負擔，對教師供給範圍進行了清理，辭退沒有“民師聘用書”和“民師供給卡”的民師276人。民辦教師在一定時期給教育事業作出了極大的貢獻，他們付出較多，有的民師把畢生的精力都奉獻給了教育事業，而回報很少，財政每月定補38元，村級按年補助1-XX元，辛苦一年只有XX多元的收入，現在卻因為沒有民師聘用書或民師供給卡而要離開心愛的講台，給他們在心靈上是極大的傷害。
第五、稅費改革對基礎教育的布局調整提出了新的要求，通過布局調整，擴大辦學規模，學校的基本建設，危房改造等配套資金，地方政府很難到位，後續資金無來源。專項資金在撥付過程中，由於中間環節過多，資金到位不及時。此外，還有教師的社會保障、普九債務的有效化解等問題，都是制約經濟貧困落後地區基礎教育生存和發展的因素。
綜上所述，稅費改革給基礎教育、特別是經濟不發達地區的基礎教育帶來的負面影響，不能輕視。他使貧困落後地區的教師待遇和發達地區、城市教師的待遇反差太大，造成教師心理極不平衡。面對稅費改革後，農村基礎教育財務管理的現狀，我們必須積極探索、尋找對策。否則，貧困地區基礎教育不能生存和發展，教育質量難以保證，形成惡性循環，將會嚴重製約我市經濟的發展。
農村“稅費改革”、貧困地區義務教育試行“一費制”帶來的諸多矛盾與問題，已經引起了領導的高度重視和社會各界的關注。農村義務教育正常經費需求如何保障，基礎教育的持續發展資金從何而來，核心問題是：各級政府根據各自責任和財力，積極調整各級財政預算資金支出結構比例，真正站在“科教興國”的高度，認真貫徹“保證教育優先發展和適度超前”的方針，千方百計確保農村基礎教育的“吃飯、運轉、發展”的基本需求，特別是教師“吃飯”和學校危房改造等問題要切實解決好。