（三）建設管理缺位越位。一方面是部門和鄉管理職責缺位。年以前，國土部門基本上實行的是自收自支財務體制，處於唯錢管地的狀態，出於部門利益追求和生存考慮，忽視和放鬆了農民建房用地管理。在實際工作中，鄉鎮政府履行耕地保護的責任也不夠，在經濟發展和耕地保護上，更加傾向於經濟發展。同時，縣直相關部門普遍認為農民建房用地是國土部門的事，配合管理力度不夠，加上機構改革後，鄉鎮國土資源管理人手少且素質參差不齊，造成了土地違法行為多發。另一方面是村級管理越權或越位。部分村幹部片面理解土地管理相關法律制度，以所有者和管理者的雙重身份，越位行使對集體土地的完全所有權，擅自將農用地出讓、轉讓、出租用於非農業建設，謀取經濟利益，違反了國家土地用途管理制度，造成了農村用地秩序紊亂。
（四）民眾法律意識淡薄。由於農村個人建房用地需求的急速增長，民眾對國家惠農政策認識不足，以及珍惜保護土地意識淡薄，不少農民民眾思想上存在一些錯誤觀念和不良傾向，助長了農村個人建房用地隨意性，導致農村個人建房用地管理出現了較為混亂的局面。同時，土地管理法對農民違法用地建房實行只能拆除的特殊處罰措施，而依法拆除新建房，農民經濟損失大，會產生許多不穩定因素，因而真正拆除的違建房少之又少，違法成本幾乎可以忽略不計，助長了違法占地違法建設氣焰，導致城區及結合部非法哄搶及轉讓宅基地甚至耕地建房的現象愈演愈烈。
三、加強農民建房用地管理的建議
（一）建立齊抓共管的聯動機制。目前，國土資源管理已經形成較為完善的制度框架，其中關於農民建房用地管理的一些限制性、禁止性、程式性的規定也在各級關於宅基地的檔案中均有出現，關鍵是要加以貫徹落實，並針對出現的矛盾和問題，出台切合實際具有可操作性的措施。一方面，要加強農民建房用地管理考核。充分發揮鄉鎮人民政府在農村宅基地審批中的審核作用，對各鄉鎮農民建房用地管理狀況實行考核和責任追究。建議在縣政府對鄉鎮的重點工作綜合考核體系中，加入國土資源管理考核指標，除考核容易留於形式的耕地和基本農田保護外，重點內容應放在涉及面廣的農民建房用地管理上；在鄉鎮對村級的年度考核中，也應把農民建房用地管理放在與計畫生育、社會治安同等的位置。另一方面，部門要形成規範農民建設用地管理的合力。按照《國務院辦公廳關於嚴格執行有關農村集體建設用地法律和政策的通知》的規定，結合農民建房的一些程式性要求，電力、供水部門憑農民取得的合法建設用地通知書及規劃許可證（包括改擴建）通電、通水；房產部門憑土地使用證書和規劃許可證辦理房屋產權登記；對涉及農民進行經營性建房的，工商稅務部門憑合法的土地房屋產權證明辦理工商稅務登記。
（二）大力推行農村建設用地整理。據公安縣土地節約和集約利用研究專題報告顯示，到2025年，全縣農村居民點整理潛力為14542.8公頃，但農村建設用地復墾整理在我縣尚未真正展開，而江浙一帶經濟發達地區早已嘗試並受益。根據《國土資源部關於印發〈城鄉建設用地增減掛鈎試點管理辦法〉的通知》和省國土資源廳有關檔案的規定，在符合規劃的前提下，將若干農村建設用地地塊整理復墾為耕地或農用地後並經國土資源部門驗收後納入增減掛鈎指標儲備庫，試點市縣國土資源部門按照“總量控制、封閉運行、定期考核、到期歸還”的原則，使用增減掛鈎指標的新增建設用地不占用土地利用計畫指標，不繳納新增建設用地有償使用費和耕地開墾費。在如此政策背景下，建議按照先易後難的原則，積極推行農村建設用地復墾整理，增加耕地有效面積，提高耕地質量，節約集約利用建設用地，最佳化城鄉建設用地布局。對新建中心村或居民點所需用地作為村組公共用地，不承包到各家各戶，為農民建房相對集中創造條件；對已分到農戶需調整承包經營權的，可以用復墾新增加的耕地來調整平衡，多餘的耕地村組統一對外發包用於農業生產，農戶復墾的擁有優先承包經營權。