４、執法過程對證據的收集不夠重視。
目前行政執法部門在行使職權時，雖然已十分注重對實質問題的認定，把防止錯案擺在最重要位置，但在具體工作時，仍顯得不夠認真，對“以事實為根據，以法律為準繩”的辦案準則理解不深，實際把握和套用還不夠全面。突出表現在辦案過程中不注意對證據的收集，多數只有當事人的供述，現場筆錄不夠全面，收取證據和尋找證人等必要的工作也做得不夠，缺乏以理服人和讓事實說話的意識。有時要等到當事人提起行政訴訟或申請複議，才補充尋找證據，造成被動。
５、“人情案”、“關係案”等對行政執法的干擾仍較為嚴重。
目前影響行政機關正常辦案的干擾因素較多，許多執法人員稱，現在每辦一個案件，幾乎沒有不來說情的。有時，執法部門才剛剛開始接觸一個案件，說情者就已經到了。說情人來自方方面面，也有相當數量領導幹部，他們的干擾就更為嚴重。例如沙縣工商局依法查處一家盜版印刷的印刷廠，依法罰款３萬元，處罰決定做出後，縣有關領導就提出不同意見，最後只得簡單處理了事，沒有達到震攝的作用。由於干擾較多，行政機關在執法中對案情的把握有失公正，處罰的輕重不同，這更加造就了當事人尋找關係、尋找庇護等不良心態。
６、執法部門因利益趨動而造成的執法偏差仍存在。
目前，由於經濟利益的因素而造成執法偏差的問題仍相當突出。現在行政部門的正常辦公經費和辦案經費普遍不足，一些單位甚至不能得到全額拔款，例如衛生防疫部門只能６０％拔給，尚有４０％需靠自收。公安部門現在的辦案經費基本沒有保證，只能靠罰沒收入，市公安局需通過罰沒款來彌補經費上的不足，其數額每年達數百萬元。由於皇糧不足，只好多罰沒。因此，執法部門都爭辦有“油水”的案件，對沒“油水”的日常“瑣事”就疏於管理。與此同時，在執法處理上也存在偏差，一些本應～、拘留或強制拆除、強制取締的案件也多以罰沒解決，甚至出現當事人以罰沒數額來計算得失的情況，當罰沒處分合算時，依然再次違法，給行政管理帶來許多不利的後果。
７、執法部門重實體，輕程式的現象相當普遍。
雖然這幾年行政執法部門已開始認識到程式問題的重要性，但採取的措施不夠有力，對違反程式的處理也不徹底，因此，行政執法中的程式不合格的問題仍相對突出。例如公安機關在辦案中經常出現先採取強制措施而後立案、先執行而後裁決、裁決書不送達當事人、不告知當事人的訴權、不開傳喚證就傳呼當事人等情況。有的縣公安局對外地人在本地作案不加區分是否流竄犯罪一律刑事拘留，辦理未成年案件也沒有請監護人到場等。行政執法人員在執法時也比較隨意，多無主動出示有效證件。執法人員對執法程式普遍不夠重視，實際執行中不夠嚴謹，有的已造成執法行為的無效。從這幾年提起行政訴訟和行政複議的情況分析，因行政執法程式不合格而被撤消的行政行為已占一定比例，說明程式問題是依法行政中的重要環節，決不可以等閒視之。