**新型農村合作醫療制度的初步建立，在不同的社會層面上產生了深刻的反響，並發揮著多方面的積極作用。
一是提高了農民基本醫療保障水平，增強了農民的健康意識。合作醫療的實施，極大地調動了參合農民住院就診的主動性，農民的健康意識發生了明顯的變化，以往農民“小病拖，大病挨，挨不過了土裡埋”的現象得到了有效改善。同時，通過合作醫療，不僅減輕了農民的經濟負擔，而且在一定程度上解決了農民“因病致貧、因病返貧”的問題。
二是融洽了黨群關係，促進了社會和諧。新型農村合作醫療的實施，在很大程度上解決了農民看病難、不敢看病和看不起病的問題，使參合農民得到了實實在在的實惠，充分體現了黨和政府的親民惠民政策，進一步密切了黨群、幹群關係，極大地提高了黨和政府在民眾中的威信，受到了大多數農民民眾的衷心擁護，不僅維護了農村社會穩定，而且進一步促進了農村社會的和諧發展。
三是最佳化了農村衛生資源配置，推進了農村衛生事業發展。參合農民可以自主選擇定點醫療機構就診，增強了定點醫療機構公平競爭意識，推進了農村衛生體制改革，最佳化了農村衛生資源配置，建立健全了農村衛生服務體系，規範了農村衛生服務行為，從而加快了農村衛生事業發展，實現了患者滿意與醫療機構自我發展的“雙贏”目標。
二、矛盾與問題
**的新型農村合作醫療試點雖然取得了階段性成效，但也暴露出一些體制
和機制上的矛盾與問題。
(一)制度設計存在局限性
新型農村合作醫療制度設計的本身具有明顯的大病統籌特徵，因而它無法很好地兼顧大多數參合農民患病就醫受益問題，在實踐中突出表現在：
1.補償範圍窄。住院補償的項目設限過多，對大型醫療設備的檢查費用以及患者住院前發生的相關檢查費用未能納入補償範圍。同時，新型農村合作醫療藥品目錄品種少、藥品老、適應性差，不能有效滿足患者的基本治療需求。慢性病補償病種過少，目前慢性病補償病種僅限於8種，對其他需長期門診治療且費用較大的慢性病，如再生障礙性貧血、類風濕性關節炎、慢性腎炎、精神並慢性胃並潰瘍並系統性紅斑狼瘡等均未納入。就**而言，長期困擾農民的慢性病就高達20餘種，僅將8種慢性病納入補償範圍是難以覆蓋到大多數農民的。一些特殊病種未能解決，如門診手術治療、超音波碎石及特殊病人γ刀等未能納入補償範圍。
2.門檻費高。無論是職工醫保，還是新型農村合作醫療制度設計都要求設定一定的門檻費。從**看，現行住院補償的門檻費為300元，慢性病補償的門檻費為500元。過高的門檻費，致使相當一部分農民有病不醫，小病拖大病抗，挫傷了相當一部分農民參合的積極性，不利於提高農村整體醫療保障水平，也有悖於合作醫療制度設計的初衷。
3.比例不一。各地在新型農村合作醫療實施過程中，實際上都普遍存在著分級分段補償的做法。從**縣補償情況來看，縣內住院補償明顯高於縣外住院補償。以住院醫藥費在1001元——3000元段別為例，當地鄉鎮醫療機構補償比例為40%，當地縣級醫療機構補償比例為20%，而縣級以上及縣外醫療機構補償比例僅為10%。分級分段補償雖然有利於引導參合農民就地就近就醫治療，卻不利於患者接受更高更好的醫療服務，對一些確需外出治療的農民存在明顯的制度不公，弱化了大病救助功能，降低了農民受償水平，存在著濃厚的地方保護主義色彩。